More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0060 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  100 
 
 		 533 aa  1040    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  49.15 
 
 		 553 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  46.42 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  45.05 
 
 		 548 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  45.94 
 
 		 521 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  45.94 
 
 		 521 aa  362  8e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  43.46 
 
 		 554 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  46.37 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  43.76 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  53.44 
 
 		 541 aa  310  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0392  peptidase M48, Ste24p  45.11 
 
 		 525 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  36.42 
 
 		 605 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  38.45 
 
 		 561 aa  256  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  37.42 
 
 		 569 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  37.01 
 
 		 567 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  33.07 
 
 		 562 aa  246  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  31.73 
 
 		 565 aa  235  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  36.17 
 
 		 564 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  36.27 
 
 		 564 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  36.91 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  36.95 
 
 		 564 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  35.92 
 
 		 588 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  36.55 
 
 		 588 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  36.55 
 
 		 588 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  35.37 
 
 		 573 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  43.7 
 
 		 560 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  43.7 
 
 		 572 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 		 483 aa  213  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  43.7 
 
 		 572 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  43.7 
 
 		 572 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  43.7 
 
 		 589 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  43.7 
 
 		 572 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  43.7 
 
 		 589 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  40.97 
 
 		 589 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  32.89 
 
 		 562 aa  211  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  32.95 
 
 		 590 aa  207  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.45 
 
 		 502 aa  204  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  35.7 
 
 		 479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  41.09 
 
 		 569 aa  197  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  32.77 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  33.47 
 
 		 518 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 		 487 aa  187  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.46 
 
 		 475 aa  187  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  29.9 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  41.56 
 
 		 500 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  31.6 
 
 		 489 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  30.77 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  29.09 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2202  peptidase M48, Ste24p  39.86 
 
 		 486 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000223537  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  29.38 
 
 		 489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  30.42 
 
 		 489 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 		 489 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  30.42 
 
 		 489 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  30.22 
 
 		 489 aa  173  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  29.14 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  29.07 
 
 		 485 aa  171  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  33.13 
 
 		 478 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 488 aa  169  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  29.42 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  29.64 
 
 		 484 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  32.11 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  33.13 
 
 		 478 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 		 486 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 		 474 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  34.67 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  29.74 
 
 		 490 aa  163  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  29.28 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  31.26 
 
 		 488 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  34.19 
 
 		 483 aa  159  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  29.89 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  37.45 
 
 		 480 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  29.4 
 
 		 484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  31.57 
 
 		 477 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  31.02 
 
 		 477 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  28.25 
 
 		 487 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  30.13 
 
 		 487 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  30.13 
 
 		 487 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  30.13 
 
 		 487 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.37 
 
 		 487 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.37 
 
 		 487 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  33.53 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  30.04 
 
 		 487 aa  152  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1658  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  36.21 
 
 		 481 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  29.8 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  29.8 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  29.8 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  29.8 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  29.8 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  29.8 
 
 		 487 aa  147  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  29.8 
 
 		 487 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  29.05 
 
 		 487 aa  146  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  34.85 
 
 		 487 aa  146  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  29.27 
 
 		 524 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  29.48 
 
 		 487 aa  145  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  29.27 
 
 		 494 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>