More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0053 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0053  transglutaminase-like domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573487  normal  0.187111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3848  transglutaminase domain-containing protein  75.56 
 
 		 294 aa  434  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0499  transglutaminase domain protein  71.48 
 
 		 272 aa  404  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6594  transglutaminase domain protein  57.93 
 
 		 295 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2641  transglutaminase domain protein  57.88 
 
 		 279 aa  314  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.634022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2834  transglutaminase domain protein  57.14 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2611  transglutaminase domain-containing protein  56.78 
 
 		 279 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2448  transglutaminase domain-containing protein  56.73 
 
 		 282 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1549  transglutaminase domain-containing protein  56.83 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3627  transglutaminase-like  56.09 
 
 		 277 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6778  cysteine protease transglutaminase-like protein  54.44 
 
 		 275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172204 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5101  Transglutaminase domain-containing protein  55.93 
 
 		 267 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0573  transglutaminase domain protein  57.99 
 
 		 269 aa  299  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337739  hitchhiker  1.50063e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6059  transglutaminase domain-containing protein  55.93 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.447718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2007  transglutaminase domain protein  55.56 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5603  transglutaminase domain-containing protein  55.47 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.948306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1813  transglutaminase domain protein  55.93 
 
 		 280 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0489377  hitchhiker  0.00559898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2253  transglutaminase-like  55.02 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.444254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3734  transglutaminase domain protein  54.24 
 
 		 282 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3214  transglutaminase-like  54.98 
 
 		 283 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.87753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0968  transglutaminase-like  52.59 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.311005  hitchhiker  0.00415605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1280  transglutaminase-like  51.48 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3838  transglutaminase-like  51.85 
 
 		 275 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0227022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3823  transglutaminase domain-containing protein  52.77 
 
 		 290 aa  280  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2636  transglutaminase domain-containing protein  53.14 
 
 		 292 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000217317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0949  transglutaminase-like  51.85 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1465  transglutaminase domain protein  50 
 
 		 275 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1568  transglutaminase domain protein  52.96 
 
 		 280 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.843556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1037  transglutaminase domain protein  51.85 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3818  transglutaminase domain protein  51.11 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0188105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1038  transglutaminase domain protein  51.29 
 
 		 280 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.149694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3917  transglutaminase domain-containing protein  52.77 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0886  transglutaminase domain-containing protein  52.77 
 
 		 280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335209  normal  0.197216 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3180  transglutaminase-like enzyme  52.4 
 
 		 270 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1265  transglutaminase domain protein  47.78 
 
 		 267 aa  260  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0003199  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3280  transglutaminase-like domain-containing protein  48.15 
 
 		 290 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243081  normal  0.406519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3478  transglutaminase domain-containing protein  48.34 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.208426 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3938  hypothetical protein  49.82 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1401  transglutaminase domain protein  42.22 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0191843  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4535  transglutaminase domain protein  38.87 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.356171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0248  transglutaminase domain protein  38.58 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3986  transglutaminase domain-containing protein  39.15 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.768545  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0776  transglutaminase domain-containing protein  36.72 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5599  transglutaminase domain protein  35.07 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.835222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3990  transglutaminase domain-containing protein  36.5 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4408  transglutaminase domain protein  36.54 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1983  transglutaminase-like domain-containing protein  35.16 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5348  transglutaminase domain protein  33.7 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1476  transglutaminase domain-containing protein  34.32 
 
 		 265 aa  144  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1588  transglutaminase domain-containing protein  33.46 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0034  transglutaminase domain-containing protein  39.08 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0510  transglutaminase-like  43.4 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1854  transglutaminase domain-containing protein  35.47 
 
 		 327 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2697  hypothetical protein  34.31 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.251988 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1060  transglutaminase domain-containing protein  36.86 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5745  transglutaminase-like  35.54 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0068  transglutaminase-like  39.08 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.641599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2648  transglutaminase domain protein  33.7 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.982294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2618  transglutaminase domain-containing protein  34.44 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.135737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2925  transglutaminase domain-containing protein  33.58 
 
 		 286 aa  131  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2841  transglutaminase domain protein  34.07 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2601  transglutaminase-like enzymes, putative cysteine protease  30.92 
 
 		 282 aa  128  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3063  transglutaminase domain-containing protein  42.44 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139568  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3166  transglutaminase domain protein  33.07 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3269  putative transglutaminase-like enzyme  42.2 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1183  transglutaminase domain-containing protein  40.31 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2205  transglutaminase-like  31.84 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3243  transglutaminase-like  35.68 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.424539  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1205  transglutaminase domain-containing protein  28.97 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2553  transglutaminase domain-containing protein  32.37 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422669  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2290  transglutaminase domain protein  34.88 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000247299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4391  transglutaminase domain-containing protein  30.86 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1686  hypothetical protein  36.21 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0117991  normal  0.0423995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15600  transglutaminase-like enzyme, predicted cysteine protease  36.65 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.822663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1224  transglutaminase domain-containing protein  29.5 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1197  transglutaminase-like protein  29.5 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1214  transglutaminase domain-containing protein  29.5 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.998145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1043  transglutaminase domain-containing protein  27.55 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2168  transglutaminase domain protein  34.15 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.479462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0804  transglutaminase domain protein  29.44 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  30.43 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  29.49 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1744  transglutaminase domain protein  31.98 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0466313  normal  0.0469356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3510  transglutaminase domain protein  30.77 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  30.4 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4573  transglutaminase domain protein  33.33 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  29.6 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  29.03 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2775  transglutaminase-like protein  32 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3644  transglutaminase domain protein  35.85 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2498  transglutaminase-like  28.57 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  34.42 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2100  transglutaminase domain-containing protein  37.93 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.678526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  29.13 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3181  transglutaminase domain protein  34.19 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1623  transglutaminase domain-containing protein  31.79 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  0.201217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2219  transglutaminase domain protein  30 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219204 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2797  transglutaminase domain protein  35.54 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  29 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  27.93 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>