27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0051 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0051  putative carboxypeptidase  100 
 
 		 365 aa  738    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.103758  normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2025  putative carboxypeptidase  67.16 
 
 		 373 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4525  zinc carboxypeptidase-related protein  57.61 
 
 		 344 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.988976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0840  zinc carboxypeptidase-related protein  57.31 
 
 		 344 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.387339  normal  0.0855585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4289  hypothetical protein  58.38 
 
 		 340 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4624  peptidase M14 carboxypeptidase A  54.63 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.144195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3437  hypothetical protein  56.05 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4190  putative metalloproteinase (zinc carboxypeptidase-related protein)  55.95 
 
 		 343 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1285  hypothetical protein  54.55 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3538  hypothetical protein  49.55 
 
 		 355 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3295  putative carboxypeptidase  44.21 
 
 		 365 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.265399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2903  hypothetical protein  44.64 
 
 		 337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0368  zinc-binding domain-containing protein  49.67 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.499164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0774  zinc carboxypeptidase-related protein  44.8 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1742  zinc carboxypeptidase-related protein  45.27 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.212306  hitchhiker  0.00119795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2718  zinc carboxypeptidase-related protein  45.27 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.792819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2643  zinc carboxypeptidase-related protein  45.27 
 
 		 342 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2604  zinc carboxypeptidase-related protein  45.27 
 
 		 342 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3019  zinc carboxypeptidase-related protein  46.71 
 
 		 340 aa  255  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.266904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1975  Zinc carboxypeptidase-related protein  43.11 
 
 		 342 aa  251  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2282  zinc carboxypeptidase-related protein  43.79 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.548754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2472  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring)  42.73 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.319923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2354  zinc carboxypeptidase-related protein  44.91 
 
 		 341 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.74 
 
 		 889 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_4102  predicted protein  34.52 
 
 		 241 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  unclonable  0.0000187913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2610  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.88 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1198  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.88 
 
 		 606 aa  43.1  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>