106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0042 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0042  BrkB-like serum-resistance protein  100 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.363004  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1876  ribonuclease BN  35.34 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0297  ribonuclease BN  33.21 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.421979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3408  ribonuclease BN  35.66 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0329161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1209  ribonuclease BN  36.98 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0967  ribonuclease BN  34.98 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3921  putative ribonuclease BN  31.73 
 
 		 360 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00855127  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5809  ribonuclease BN, putative  34.91 
 
 		 321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2153  ribonuclease BN, putative  34.56 
 
 		 321 aa  132  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6562  ribonuclease BN  31.37 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2621  ribonuclease BN  33.57 
 
 		 304 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1697  putative ribonuclease BN  34.33 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.318237  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0744  putative ribonuclease  34.33 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1883  putative ribonuclease BN  34.33 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.244601  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2276  putative ribonuclease BN  34.33 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4029  ribonuclease BN  33.84 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2414  putative ribonuclease BN  34.33 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1517  ribonuclease BN  38.13 
 
 		 321 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0703  YihY family protein  34.33 
 
 		 325 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.075214  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1675  putative ribonuclease BN  33.96 
 
 		 307 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.753662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2102  ribonuclease BN  34.44 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.316673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1669  ribonuclease BN, putative  37.59 
 
 		 326 aa  122  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3201  ribonuclease BN  37.54 
 
 		 309 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3546  ribonuclease BN  34.07 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4516  ribonuclease BN  37.06 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.783235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5335  ribonuclease BN  34.59 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4384  ribonuclease BN, putative  34.07 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2372  ribonuclease BN  28.99 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3982  putative ribonuclease BN  34.07 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4448  ribonuclease BN  34.04 
 
 		 443 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0111149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3375  putative ribonuclease BN  34.2 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.594125 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3877  ribonuclease BN  33.96 
 
 		 310 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0221  ribonuclease BN  34.91 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4599  ribonuclease BN  33.7 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.150471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2533  ribonuclease BN  32.01 
 
 		 311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2481  ribonuclease BN  32.63 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  0.806631 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3764  ribonuclease BN  31.72 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0316697  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3875  ribonuclease BN  31.72 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0412  ribonuclease BN  29.55 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3473  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.950669 
 
 
-
 
NC_003296  RS02223  putative ribonuclease RNase BN (RBN) transmembrane protein  32.37 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4408  ribonuclease BN  32.45 
 
 		 427 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2216  ribonuclease BN  35.77 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.987558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2801  ribonuclease BN  30.47 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0769  ribonuclease BN  35.21 
 
 		 411 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2225  ribonuclease BN  31.32 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.681291  decreased coverage  0.00304933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3922  ribonuclease BN  31.5 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644027  normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1947  ribonuclease BN  32.95 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.594213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1591  ribonuclease BN  27.61 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.884253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0258  ribonuclease BN  32.61 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6636  ribonuclease BN  26.22 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10418  hypothetical protein  28.47 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1838  ribonuclease BN, putative  32.58 
 
 		 301 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.787321  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0151  ribonuclease BN  35.44 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1291  ribonuclease BN  32.71 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0169  ribonuclease BN  35.61 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0417869  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2469  putative ribonuclease BN  29.28 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.428751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2667  ribonuclease BN  28.83 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0611062  normal  0.153348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3481  ribonuclease BN family protein  35.69 
 
 		 306 aa  92.4  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2157  ribonuclease BN  31.18 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3548  ribonuclease  22.79 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0230388  normal  0.0399226 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5700  ribonuclease BN  36.5 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0471671 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2352  ribonuclease BN  30.96 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3282  ribonuclease BN  20.73 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04098  ribonuclease BN  29.18 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1806  ribonuclease BN  30.12 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1738  ribonuclease BN  30.12 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.554379  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4202  ribonuclease BN  27.62 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4870  putative ribonuclease  27.57 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0433032  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1561  putative ribonuclease  28.22 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51960  ribonuclease  26.87 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4558  ribonuclease  26.49 
 
 		 411 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1519  ribonuclease BN  28.92 
 
 		 424 aa  48.9  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2988  tRNA-processing RNAse BN  25.53 
 
 		 405 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0324  ribonuclease BN  25.67 
 
 		 314 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2561  ribonuclease RN  22.56 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3448  ribonuclease BN  27.02 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.016816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2802  ribonuclease BN  25.26 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36810  Ribonuclease BN-like protein  27.31 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0331  ribonuclease BN  26.55 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.533981  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3782  putative ribonuclease BN  29.92 
 
 		 417 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.747411  normal  0.886826 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0302  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.223678  hitchhiker  0.000000133239 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4075  hypothetical protein  23.59 
 
 		 357 aa  45.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.90745  normal  0.0226711 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0409  ribonuclease BN  27.46 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1765  YihY family protein  27.46 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3068  ribonuclease BN  29.2 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0617893  hitchhiker  0.000205961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0077  ribonuclease BN  20.31 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0630  putative ribonuclease BN  23.66 
 
 		 538 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883121 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1577  ribonuclease BN  28.92 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.013095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0083  ribonuclease  25.27 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0363  serum resistance locus BrkB-like  26.42 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4056  ribonuclease BN-like family protein  23.69 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0106  ribonuclease  23.34 
 
 		 366 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1902  YihY family protein  29.14 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.567508  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0087  ribonuclease  24.19 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1213  hypothetical protein  25.36 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1230  putative ribonuclease  25.36 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4744  putative ribonuclease  24.72 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3909  ribonuclease BN  27.24 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6469  ribonuclease  29.27 
 
 		 339 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>