57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0041 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0041  putative lipoprotein  100 
 
 
206 aa  393  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.240026  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  44.5 
 
 
197 aa  127  9e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  44.5 
 
 
192 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  34.5 
 
 
199 aa  118  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  42.41 
 
 
196 aa  112  4e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  110  2e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1569  hypothetical protein  35.1 
 
 
209 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.849012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  34.69 
 
 
204 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  38.58 
 
 
201 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  39.5 
 
 
196 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0404  hypothetical protein  34.18 
 
 
203 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2680  putative lipoprotein  36.18 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208689  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  40.14 
 
 
197 aa  84.3  1e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6349  hypothetical protein  33.51 
 
 
225 aa  78.2  8e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238642  normal  0.295075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  33.01 
 
 
201 aa  77  2e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  35.93 
 
 
238 aa  70.5  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0625  hypothetical protein  32.96 
 
 
240 aa  70.9  1e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  33.92 
 
 
242 aa  70.5  2e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  35.93 
 
 
238 aa  70.5  2e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  35.93 
 
 
239 aa  70.5  2e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1231  protein of unknown function DUF330  38.22 
 
 
202 aa  68.9  6e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228197  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  36.69 
 
 
240 aa  68.2  9e-11  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2675  hypothetical protein  34.13 
 
 
243 aa  67.4  1e-10  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681553  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1982  putative lipoprotein  32.47 
 
 
195 aa  67  2e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0024934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2536  hypothetical protein  31.69 
 
 
233 aa  63.9  2e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4001  hypothetical protein  32.02 
 
 
250 aa  63.9  2e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0578  hypothetical protein  34.15 
 
 
195 aa  63.2  3e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410916  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1153  putative lipoprotein  32.02 
 
 
256 aa  61.6  7e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2377  putative lipoprotein  32.02 
 
 
256 aa  61.6  7e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3383  hypothetical protein  32.02 
 
 
256 aa  61.6  7e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1267  hypothetical protein  32.04 
 
 
264 aa  61.6  7e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3534  hypothetical protein  34.25 
 
 
253 aa  61.6  8e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0808039  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0291  putative lipoprotein  32.02 
 
 
252 aa  61.6  9e-09  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2560  putative lipoprotein  32.02 
 
 
252 aa  61.6  9e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3375  putative lipoprotein  32.02 
 
 
252 aa  61.2  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3341  hypothetical protein  32.02 
 
 
239 aa  61.2  1e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  30.56 
 
 
248 aa  61.2  1e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  28.57 
 
 
198 aa  59.7  3e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0256  hypothetical protein  31.13 
 
 
205 aa  58.2  9e-08  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  25.96 
 
 
212 aa  57.8  1e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  39.23 
 
 
200 aa  57  2e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2126  putative lipoprotein  28.64 
 
 
233 aa  54.7  9e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0863972  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0327  protein of unknown function DUF330  34.31 
 
 
204 aa  53.5  2e-06  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  21.35 
 
 
211 aa  53.1  3e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2892  protein of unknown function DUF330  34.56 
 
 
210 aa  51.2  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.529816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5692  hypothetical protein  30.53 
 
 
236 aa  48.1  8e-05  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3508  resolvase, RNase H-like fold  33.66 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5279  hypothetical protein  26.97 
 
 
233 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65590  hypothetical protein  29.77 
 
 
236 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  29.32 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5258  hypothetical protein  34.65 
 
 
194 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.960126  normal  0.0530177 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  27.18 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5821  hypothetical protein  32.71 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514246  normal  0.606405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4959  lipoprotein, putative  26.92 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2832  hypothetical protein  25.26 
 
 
183 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.766034  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1714  hypothetical protein  32.17 
 
 
232 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.67749e-09 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2579  hypothetical protein  30.67 
 
 
191 aa  42  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.621383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>