210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0038 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0038  putative paraquat-inducible protein  100 
 
 
200 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303986  normal  0.0916917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0401  paraquat-inducible protein A  54.12 
 
 
221 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2672  paraquat-inducible protein A  47.4 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167309  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0581  paraquat-inducible protein A  45.5 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.032073  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0680  paraquat-inducible protein A  44.78 
 
 
221 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320586  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0229  paraquat-inducible protein A  44.79 
 
 
221 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0713  paraquat-inducible protein A  44.79 
 
 
221 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2677  paraquat-inducible protein A  45.64 
 
 
223 aa  165  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44070  PqiA family protein  52.31 
 
 
204 aa  164  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11375  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1572  paraquat-inducible protein A  43.46 
 
 
208 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.962502  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0628  paraquat-inducible protein A  43.23 
 
 
220 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0604  paraquat-inducible protein A  42.71 
 
 
220 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.816957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0808  paraquat-inducible protein A  49.71 
 
 
229 aa  158  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3998  putative paraquat-inducible protein  43.75 
 
 
251 aa  157  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531017 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0707  Paraquat-inducible protein A  44.79 
 
 
261 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.769315  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3244  Paraquat-inducible protein A  49.74 
 
 
209 aa  154  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1998  Paraquat-inducible protein A  47.92 
 
 
209 aa  154  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3801  paraquat-inducible protein A  45.31 
 
 
221 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1270  hypothetical protein  43.52 
 
 
218 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3380  putative paraquat-inducible protein  43.52 
 
 
218 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0294  paraquat-inducible protein A  43.52 
 
 
218 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1156  paraquat-inducible protein A  43.52 
 
 
218 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3338  paraquat-inducible protein A  43.52 
 
 
218 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3372  paraquat-inducible protein A  43.52 
 
 
218 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.656433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2563  paraquat-inducible protein A  43.52 
 
 
218 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0650  PqiA family integral membrane protein  46.88 
 
 
449 aa  144  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0149918  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2895  Paraquat-inducible protein A  43.62 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2533  paraquat-inducible protein A  43.92 
 
 
245 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0259  paraquat-inducible protein A  37.5 
 
 
198 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0330  Paraquat-inducible protein A  38.02 
 
 
227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  43.37 
 
 
423 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6818  paraquat-inducible protein A  38.58 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3536  PqiA family integral membrane protein  40.2 
 
 
449 aa  124  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.281669  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3043  paraquat-inducible protein A  35.79 
 
 
212 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.121021 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2694  paraquat-inducible protein A  40.1 
 
 
226 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0603  hypothetical protein  36.65 
 
 
292 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124189  normal  0.58496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0532  Paraquat-inducible protein A  37.7 
 
 
259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  40.21 
 
 
460 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0519  Paraquat-inducible protein A  37.5 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3141  paraquat-inducible protein A  36.42 
 
 
198 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  33.68 
 
 
444 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4782  paraquat-inducible protein A  34.34 
 
 
219 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4565  paraquat-inducible protein A  34.34 
 
 
219 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0643  paraquat-inducible protein A  34.34 
 
 
219 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766224  hitchhiker  0.00309021 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  43.35 
 
 
462 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3290  paraquat-inducible protein A  36.42 
 
 
198 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.973977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2441  paraquat-inducible protein A  34.92 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501782  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5398  PqiA family protein  31.31 
 
 
218 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0407212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0638  paraquat-inducible protein A  33.84 
 
 
219 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.205765 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62040  putative paraquat-inducible protein  30.81 
 
 
235 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0218232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1013  paraquat-inducible protein A  34.34 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.473399  normal  0.115279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  28.34 
 
 
402 aa  95.1  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  29.35 
 
 
207 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  31.96 
 
 
464 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  28.5 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1351  paraquat-inducible protein A  30.54 
 
 
434 aa  93.6  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00603606  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1447  Paraquat-inducible protein A  32.75 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  30.46 
 
 
206 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3326  paraquat-inducible protein A  29.85 
 
 
205 aa  92  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.419894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  30.15 
 
 
413 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  27.78 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  28.5 
 
 
207 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  32.14 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42470  Paraquat-inducible protein A  32.32 
 
 
219 aa  89  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  29.95 
 
 
206 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  29.44 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3374  paraquat-inducible protein A  30.21 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0510554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  30.05 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  29.21 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  31.16 
 
 
224 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  28.06 
 
 
423 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  29.03 
 
 
405 aa  85.1  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  28.43 
 
 
205 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  29.29 
 
 
213 aa  84.7  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  30.35 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2582  paraquat-inducible protein A  33.74 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.651094 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1745  PqiA family integral membrane protein  26.87 
 
 
414 aa  82.4  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0758068  hitchhiker  0.0000336386 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  26.44 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02850  hypothetical protein  26.34 
 
 
426 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  26.29 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  25.89 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  31.44 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  29.19 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  24.87 
 
 
419 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  25.63 
 
 
417 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  25.63 
 
 
417 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  26.96 
 
 
252 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  25.63 
 
 
417 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  26.94 
 
 
422 aa  79  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 
417 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  25.63 
 
 
417 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 
417 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3289  paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 
417 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 
417 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  25.63 
 
 
417 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  28.78 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  28.06 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  28 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  24.5 
 
 
428 aa  78.2  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>