More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0023 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  66.67 
 
 
682 aa  820  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  63.62 
 
 
660 aa  731  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.88 
 
 
605 aa  668  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5203  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.09 
 
 
941 aa  658  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  60.73 
 
 
641 aa  728  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  63.68 
 
 
685 aa  736  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  68.41 
 
 
666 aa  817  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.07 
 
 
666 aa  818  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  54.63 
 
 
665 aa  666  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  58.75 
 
 
604 aa  663  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.05 
 
 
608 aa  770  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  58.91 
 
 
604 aa  665  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.24 
 
 
630 aa  780  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  66.96 
 
 
688 aa  808  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.74 
 
 
678 aa  639  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  63.68 
 
 
671 aa  733  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.81 
 
 
650 aa  815  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  100 
 
 
661 aa  1313  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.14 
 
 
621 aa  676  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  63.62 
 
 
660 aa  731  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  63.62 
 
 
660 aa  731  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  63.82 
 
 
660 aa  734  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.56 
 
 
679 aa  773  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  63.62 
 
 
660 aa  734  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  57.56 
 
 
626 aa  659  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.59 
 
 
560 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.79 
 
 
644 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  72.1 
 
 
610 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  71.18 
 
 
657 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  71.36 
 
 
662 aa  614  1e-174  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.65 
 
 
629 aa  611  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  67.73 
 
 
774 aa  605  1e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  62.16 
 
 
444 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.41 
 
 
664 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.64 
 
 
674 aa  539  1e-152  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  61.92 
 
 
673 aa  537  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  61.64 
 
 
672 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  55.69 
 
 
420 aa  489  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.29 
 
 
451 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.7 
 
 
408 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.7 
 
 
404 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.45 
 
 
412 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  51.36 
 
 
419 aa  469  1e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.44 
 
 
404 aa  471  1e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56 
 
 
418 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  51.4 
 
 
425 aa  460  1e-128  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.99 
 
 
413 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  52.94 
 
 
414 aa  454  1e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.94 
 
 
413 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.26 
 
 
404 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.45 
 
 
413 aa  442  1e-122  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  50.25 
 
 
405 aa  439  1e-122  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  50.25 
 
 
405 aa  440  1e-122  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  55.15 
 
 
417 aa  441  1e-122  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.27 
 
 
416 aa  439  1e-122  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.66 
 
 
419 aa  441  1e-122  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.47 
 
 
414 aa  442  1e-122  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  52.61 
 
 
413 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  53 
 
 
429 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.78 
 
 
415 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  52.38 
 
 
404 aa  438  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.76 
 
 
429 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.84 
 
 
421 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.52 
 
 
429 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  53.22 
 
 
414 aa  435  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  51.14 
 
 
412 aa  433  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.76 
 
 
429 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  52.72 
 
 
414 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  52.76 
 
 
415 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.75 
 
 
417 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.04 
 
 
414 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.47 
 
 
413 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.66 
 
 
425 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  50.62 
 
 
414 aa  432  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  50.62 
 
 
414 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49 
 
 
408 aa  430  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.07 
 
 
414 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  48.15 
 
 
412 aa  427  1e-118  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.98 
 
 
415 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.49 
 
 
420 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.74 
 
 
406 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.12 
 
 
428 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  49.4 
 
 
422 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.76 
 
 
415 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.24 
 
 
414 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  51.51 
 
 
414 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.88 
 
 
415 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.59 
 
 
427 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.5 
 
 
406 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  7.97081e-10 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.5 
 
 
406 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04018e-08 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51.5 
 
 
406 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  49.11 
 
 
406 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  49.11 
 
 
406 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  49.11 
 
 
406 aa  420  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  49.11 
 
 
406 aa  420  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.75 
 
 
406 aa  418  1e-115  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  6.02764e-07 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.75 
 
 
406 aa  418  1e-115  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  1.07568e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.75 
 
 
406 aa  418  1e-115  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.87 
 
 
416 aa  418  1e-115  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  51 
 
 
407 aa  416  1e-115  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>