29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0051 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0051  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.074634 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0020  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  143  7e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0022  tRNA-Ala  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.836279  normal  0.0847494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0045  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 72 bp  103  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0050  tRNA-Ala  93.06 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0035  tRNA-Ala  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.746107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0010  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000307763  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0003  tRNA-Ala  92.45 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0051  tRNA-Ala  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0048  tRNA-Ala  97.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143033  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0004  tRNA-Ala  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.554141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0007    88.06 
 
 		 203 bp  69.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.47571 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0015  tRNA-Ala  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.233572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0008  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.456159 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0039  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0028  tRNA-Ala  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0029  tRNA-Ala  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0041  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0028  tRNA-Ala  94.12 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0101867  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0054  tRNA-Ala  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0022  tRNA-Ala  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.213128  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0059  tRNA-Ala  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0347498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  91.67 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0009  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0006  tRNA-Ala  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0055  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000146939  hitchhiker  0.0000109613 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1466  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000857792  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1719  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778292  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.34848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>