85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2768 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 		 226 aa  446  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  91.11 
 
 		 226 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  85.71 
 
 		 225 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  42.15 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  40.81 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  40.36 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  41.26 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.91 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.01 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  39.91 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  38.53 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  36.36 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  35.19 
 
 		 222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.1 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  34.67 
 
 		 232 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  35.32 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  35.71 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  37.22 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  37.05 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.98 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  36.16 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.64 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  34.98 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  32.27 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  34.39 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  35.19 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  33.18 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.4 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  34.23 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  33.85 
 
 		 200 aa  95.1  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  36.06 
 
 		 221 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  31.98 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  29.41 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  32.83 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  30.18 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.5 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.35 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.1 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.54 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  32.24 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  37.33 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.71 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  32.56 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  26.69 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.77 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.48 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.44 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.78 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  29.41 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.56 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  27.64 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.58 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.96 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.64 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  28.14 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.56 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.32 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  30.46 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  30.46 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.38 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2769  hypothetical protein  84 
 
 		 43 aa  52.4  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.576996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6638  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.58 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.23 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.77 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.89 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  27.96 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2310  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.57 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.5 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2893  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.03 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.114826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.22 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.19 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.88 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.7 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  32.67 
 
 		 439 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2052  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.48 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 443 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  37.62 
 
 		 443 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.99 
 
 		 249 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2571  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.67 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26460  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent protein  25.25 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1959  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 271 aa  42  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  hitchhiker  0.00037769 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.4 
 
 		 316 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.64 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>