More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2674 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2674  phosphoglycerate kinase  100 
 
 		 407 aa  823    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.667783 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2342  phosphoglycerate kinase  70.15 
 
 		 404 aa  584  1.0000000000000001e-165  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.480216 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1251  phosphoglycerate kinase  61.19 
 
 		 405 aa  524  1e-147  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0290  phosphoglycerate kinase  66.49 
 
 		 388 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1194  phosphoglycerate kinase  62.78 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.622987  normal  0.0429324 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1808  phosphoglycerate kinase  50.12 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1345  phosphoglycerate kinase  46.75 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0817  phosphoglycerate kinase  46.84 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0608  Phosphoglycerate kinase  44.67 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0780  phosphoglycerate kinase  48.51 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.281028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0043  phosphoglycerate kinase  48.16 
 
 		 414 aa  349  4e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.212818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3562  phosphoglycerate kinase  42.89 
 
 		 413 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1138  phosphoglycerate kinase  48.27 
 
 		 414 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.927128  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0495  phosphoglycerate kinase  44.58 
 
 		 419 aa  347  3e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0845  phosphoglycerate kinase  47.52 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37156  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1600  Phosphoglycerate kinase  44.91 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3327  Phosphoglycerate kinase  43.42 
 
 		 404 aa  323  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1789  phosphoglycerate kinase  38.65 
 
 		 412 aa  290  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0925666  normal  0.515243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0773  phosphoglycerate kinase  40.59 
 
 		 409 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.1233  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0500  phosphoglycerate kinase  37.78 
 
 		 408 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1614  Phosphoglycerate kinase  39.15 
 
 		 415 aa  285  8e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1653  phosphoglycerate kinase  37.47 
 
 		 407 aa  265  1e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.973793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0744  phosphoglycerate kinase  38.07 
 
 		 411 aa  263  3e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.333208 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 650 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0633  phosphoglycerate kinase  38.68 
 
 		 408 aa  259  6e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0731  phosphoglycerate kinase  36.71 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  39.36 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1711  phosphoglycerate kinase  37.47 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0322554 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  37.56 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  37.78 
 
 		 393 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0908  phosphoglycerate kinase  39.02 
 
 		 401 aa  245  9e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  37.28 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.13 
 
 		 646 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  37.14 
 
 		 396 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2047  Phosphoglycerate kinase  40.05 
 
 		 397 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0432  phosphoglycerate kinase  39.02 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  38.56 
 
 		 395 aa  239  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  35.59 
 
 		 400 aa  239  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1257  Phosphoglycerate kinase  39.04 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 		 396 aa  239  9e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  36.32 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0443  phosphoglycerate kinase  36.23 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  36.32 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  35.56 
 
 		 392 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  36.88 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1638  phosphoglycerate kinase  40 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  36.41 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  37.13 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0798  phosphoglycerate kinase  35.73 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0814  phosphoglycerate kinase  35.73 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  38.52 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  37.66 
 
 		 443 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  35.59 
 
 		 400 aa  232  7.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  35.61 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  34.33 
 
 		 397 aa  232  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2372  phosphoglycerate kinase  40.1 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.504326 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3795  Phosphoglycerate kinase  36.71 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  37.53 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  36.19 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  35.38 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  35.68 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  37.29 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20020  phosphoglycerate kinase  36.98 
 
 		 399 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  37.59 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  35.45 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  37.32 
 
 		 396 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  34.89 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  35.48 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  34.08 
 
 		 397 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15880  phosphoglycerate kinase  38.69 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00341206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2539  Phosphoglycerate kinase  37.05 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0360426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  35.37 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  34.78 
 
 		 655 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  36.83 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf530  phosphoglycerate kinase  34.24 
 
 		 397 aa  224  1e-57  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0418919  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1252  Phosphoglycerate kinase  36.52 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  36.83 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10120  phosphoglycerate kinase  36.74 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  37.22 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  36.76 
 
 		 435 aa  223  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2980  Phosphoglycerate kinase  37.68 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.0361725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  35.22 
 
 		 394 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  33.58 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3269  Phosphoglycerate kinase  36.41 
 
 		 397 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.891729  decreased coverage  0.00998041 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  35.06 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 		 394 aa  222  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  34.98 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  36.88 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2704  phosphoglycerate kinase  36.32 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  35.42 
 
 		 400 aa  220  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  34.73 
 
 		 394 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  33.9 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>