60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2603 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2603  dehydroquinase class I  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.635582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1570  dehydroquinase class I  43.08 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.251567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1295  dehydroquinase class I  43.39 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0951135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0979  dehydroquinase class I  36.98 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0127705  normal  0.936992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0922  3-dehydroquinate dehydratase  34.58 
 
 		 242 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0540  3-dehydroquinate dehydratase, type I  31.61 
 
 		 226 aa  84.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0184  3-dehydroquinate dehydratase  28.14 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.836768  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0639  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.64 
 
 		 218 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0375735  normal  0.0370197 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1279  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.14 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.02452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1839  3-dehydroquinate dehydratase, type I  34 
 
 		 517 aa  71.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0220  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.26016  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12510  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.3 
 
 		 259 aa  71.2  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0132  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.14 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0627989  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1999  3-dehydroquinate dehydratase  27.45 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0551  3-dehydroquinate dehydratase  27.27 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.93599 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1815  3-dehydroquinate dehydratase  31.46 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.628603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0705  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.37 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.555619  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06550  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.91 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1386  3-dehydroquinate dehydratase  26.42 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.538859  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3033  3-dehydroquinate dehydratase  32.71 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2806  3-dehydroquinate dehydratase  31.67 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0481  3-dehydroquinate dehydratase  24.3 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1896  3-dehydroquinate dehydratase  28.3 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0600  dehydroquinase class I  30.81 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1640  3-dehydroquinate dehydratase, type 1, putative/shikimate 5-dehydrogenase, putative  26.14 
 
 		 493 aa  57.4  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1938  3-dehydroquinate dehydratase  28.3 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1774  3-dehydroquinate dehydratase  28.3 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01651  hypothetical protein  28.3 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01662  3-dehydroquinate dehydratase  28.3 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1495  3-dehydroquinate dehydratase  30.46 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.065136 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1949  3-dehydroquinate dehydratase, type I  27.83 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1503  3-dehydroquinate dehydratase  27.83 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1909  3-dehydroquinate dehydratase  27.83 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1460  3-dehydroquinate dehydratase, type I  24.15 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000588162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2409  3-dehydroquinate dehydratase  27.83 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2125  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0010  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.53 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.406565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2171  3-dehydroquinate dehydratase  26.53 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.70771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2881  3-dehydroquinate dehydratase  29.19 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39392  predicted protein  28.5 
 
 		 526 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.541352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2188  3-dehydroquinate dehydratase  29.81 
 
 		 253 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1182  3-dehydroquinate dehydratase  28.97 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2023  3-dehydroquinate dehydratase  25.12 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1814  3-dehydroquinate dehydratase  29.38 
 
 		 252 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.457788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1470  3-dehydroquinate dehydratase  29.38 
 
 		 243 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21823  normal  0.0154029 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2038  chorismate mutase  30 
 
 		 295 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  28.09 
 
 		 294 aa  48.9  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  29.89 
 
 		 295 aa  48.1  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0817  3-dehydroquinate dehydratase  26.21 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00820  3-dehydroquinate dehydratase  29.44 
 
 		 268 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3464  3-dehydroquinate dehydratase, type I  28.97 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1985  3-dehydroquinate dehydratase  29.22 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1454  3-dehydroquinate dehydratase  29.22 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.287229  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1489  3-dehydroquinate dehydratase  29.22 
 
 		 252 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.670449  normal  0.0179338 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1789  3-dehydroquinate dehydratase, type I  30.22 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_409  3-dehydroquinate dehydratase, type I  26.37 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1285  3-dehydroquinate dehydratase, putative (AroD)  27.07 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01990  aromatic amino acid family biosynthesis-related protein, putative  26.98 
 
 		 1611 aa  41.6  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979482  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0466  3-dehydroquinate dehydratase, type I  25.25 
 
 		 222 aa  41.2  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.248479  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0443  3-dehydroquinate dehydratase  26.9 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.277554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>