205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2600 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2600  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  100 
 
 		 101 aa  196  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0031  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  58 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.840685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1490  large-conductance mechanosensitive channel-like protein  56.25 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.105065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0035  large conductance mechanosensitive channel protein  53.47 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.262039  normal  0.835133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3243  large conductance mechanosensitive channel protein  43.56 
 
 		 101 aa  97.1  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0695939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1991  large conductance mechanosensitive channel protein  41.24 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.595696  normal  0.288973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2555  large conductance mechanosensitive channel protein  40 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  36.36 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2038  large conductance mechanosensitive channel protein  38.95 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  35.42 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3746  large conductance mechanosensitive channel protein  34.23 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3672  large conductance mechanosensitive channel protein  34.23 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  35.29 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  35.79 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  34.55 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  36.79 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  35.58 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  33.9 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  33.04 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1318  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212571  hitchhiker  0.00243459 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1961  mechanosensitive channel  35.24 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.171648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  30.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  30.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  30.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  30.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  30.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  30.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  30.83 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3094  large-conductance mechanosensitive channel  34.23 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.350384  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1871  large-conductance mechanosensitive channel  30.36 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0110608  normal  0.0250819 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  34.58 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4749  large conductance mechanosensitive channel protein  36.56 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  30.83 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2860  large-conductance mechanosensitive channel  31.25 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.219386 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  36.67 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0134  large conductance mechanosensitive channel protein  34.82 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.172297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  31.67 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  31.67 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  31.67 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  31.67 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5504  large-conductance mechanosensitive channel  31.53 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  31.67 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  31.67 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2930  large-conductance mechanosensitive channel  31.25 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  34.02 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  34.02 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  34.02 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  34.02 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  34.02 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  33.65 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0993  large-conductance mechanosensitive channel  32.46 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.125438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3207  large-conductance mechanosensitive channel  31.25 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  34.02 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  28.45 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  35.19 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  34.02 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  35.19 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  32.14 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3697  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  33.33 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  30.36 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  31.78 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0871  large conductance mechanosensitive channel protein  37.21 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  34.51 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  29.13 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2316  large-conductance mechanosensitive channel  29.46 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0475958  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  30.17 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  29.25 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  35.79 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1262  hypothetical protein  60.98 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000395651  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  31.48 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  31.53 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  32.22 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  31.19 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  32.71 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  33.7 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  36.63 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  35.05 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  37.38 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  32.56 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  31.53 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3196  large-conductance mechanosensitive channel  31.13 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.977942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  32.74 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  32.22 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  35.56 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  37.38 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  28.89 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3652  large-conductance mechanosensitive channel  33.01 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.326365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  28.83 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  35.05 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  35.51 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  35.51 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  35.51 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>