More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2571 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 
137 aa  284  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  63.08 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.45 
 
 
152 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0054  protein tyrosine phosphatase  58.96 
 
 
146 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.63 
 
 
140 aa  158  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  55.22 
 
 
143 aa  156  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  52.55 
 
 
138 aa  153  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  54.4 
 
 
139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.12 
 
 
143 aa  141  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  50.77 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  53.97 
 
 
140 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  51.59 
 
 
140 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.39 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  48.15 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.39 
 
 
137 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.39 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  50.75 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  52.63 
 
 
258 aa  127  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  44.36 
 
 
148 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  50.39 
 
 
142 aa  126  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  44.03 
 
 
142 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  49.61 
 
 
142 aa  123  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  43.2 
 
 
150 aa  123  8.000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.88 
 
 
139 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 
146 aa  122  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.09 
 
 
137 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  46.62 
 
 
142 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.93 
 
 
138 aa  120  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  47.15 
 
 
254 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  48.82 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  49.22 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
258 aa  118  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  46.46 
 
 
139 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.88 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  47.58 
 
 
144 aa  117  6e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.42 
 
 
144 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
142 aa  117  7e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  44.8 
 
 
164 aa  116  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  44.68 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  47.29 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  43.88 
 
 
144 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  46.92 
 
 
147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 
151 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  44.7 
 
 
148 aa  113  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  43.61 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  42.52 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  48.51 
 
 
141 aa  111  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 
144 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  37.78 
 
 
154 aa  110  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  42.97 
 
 
144 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  41.67 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
255 aa  108  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
157 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.75 
 
 
139 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.46 
 
 
153 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  40.16 
 
 
143 aa  104  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  40.31 
 
 
138 aa  104  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 
143 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  38.64 
 
 
151 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  44.8 
 
 
140 aa  103  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2401  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
169 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.571315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  45.22 
 
 
132 aa  103  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  42.4 
 
 
131 aa  103  9e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  42.31 
 
 
154 aa  102  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  42.4 
 
 
145 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.67 
 
 
299 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  44.88 
 
 
154 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1583  arsenate reductase  45 
 
 
164 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  41.98 
 
 
144 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  44.26 
 
 
254 aa  100  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  41.98 
 
 
132 aa  100  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  40.91 
 
 
299 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  42.98 
 
 
127 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  39.2 
 
 
148 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  97.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  38.4 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.08 
 
 
164 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0845  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.44 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000114358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5577  protein tyrosine phosphatase  43.7 
 
 
175 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.163475 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  36.92 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  34.42 
 
 
188 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6562  protein tyrosine phosphatase  40.3 
 
 
168 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  45 
 
 
165 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  39.2 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6302  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.53 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.819229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  42.52 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  38.4 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3642  protein tyrosine phosphatase  42.61 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227119  normal  0.219945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
179 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.7 
 
 
165 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  42.62 
 
 
164 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>