More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2561 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  100 
 
 		 249 aa  483  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  75.1 
 
 		 249 aa  396  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  81.93 
 
 		 249 aa  383  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  73.39 
 
 		 249 aa  374  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  78.31 
 
 		 249 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  73.09 
 
 		 249 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  52.42 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  46.75 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  49.53 
 
 		 264 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  48.6 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  41.37 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  45.75 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.04 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.43 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.85 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  40.19 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.85 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  37.9 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.08 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.87 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  40.55 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  43.4 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1239  hypothetical protein  72.32 
 
 		 126 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0798004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  39.07 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  39.42 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  39.51 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  31.98 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  37.32 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  39.34 
 
 		 276 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  36.28 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  33.96 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  24.39 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  26.37 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  28.21 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  33.5 
 
 		 285 aa  105  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 297 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  27.95 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  29.8 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  29.03 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  29.22 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  29.15 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 241 aa  99.8  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 292 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  28.34 
 
 		 286 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  29.33 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  25.98 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  27.53 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  29.05 
 
 		 287 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  28.86 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 290 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4025  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  30.24 
 
 		 665 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 256 aa  92.4  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  30.65 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  29.15 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.48 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  28.11 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2137  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0672016  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 		 366 aa  88.6  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 263 aa  88.6  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.24 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>