38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2556 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2556  C_GCAxxG_C_C family protein  100 
 
 		 146 aa  299  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1937  C_GCAxxG_C_C family protein  40.97 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0465  C_GCAxxG_C_C family protein  42.36 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00655553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4296  C_GCAxxG_C_C family protein  46.27 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000101878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0460  hypothetical protein  39.31 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1399  C_GCAxxG_C_C family protein  39.04 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0718926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2781  C_GCAxxG_C_C family protein  36.62 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0045  redox family protein  32.88 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000553397  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0747  C_GCAxxG_C_C family protein  33.56 
 
 		 327 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0477  C_GCAxxG_C_C family protein  38.03 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.664237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0233  C_GCAxxG_C_C family protein  33.33 
 
 		 156 aa  94.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00763518  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_44  redox protein  32.19 
 
 		 148 aa  94  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000630666  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0041  C_GCAxxG_C_C family protein  32.59 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000104538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2965  hypothetical protein  36.69 
 
 		 182 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0035  C_GCAxxG_C_C family protein  31.65 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2054  hypothetical protein  32.38 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0510  C_GCAxxG_C_C family protein  35.29 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00782418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2420  C_GCAxxG_C_C family protein  30.09 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2296  C_GCAxxG_C_C family protein  34.65 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01840  C_GCAxxG_C_C family probable redox protein  34.09 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0865  C_GCAxxG_C_C family protein  35.65 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.578552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2578  hypothetical protein  31.16 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2280  hypothetical protein  30.43 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0224  C_GCAxxG_C_C family protein  29.9 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1447  hypothetical protein  26.47 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.281245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1719  hypothetical protein  27.45 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2887  C_GCAxxG_C_C family protein  38.39 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3781  C_GCAxxG_C_C family protein  31.58 
 
 		 146 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3143  C_GCAxxG_C_C family protein  26.92 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1199  C_GCAxxG_C_C family protein  28.81 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0479  C_GCAxxG_C_C family protein  26.67 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3529  C_GCAxxG_C_C family protein  32.17 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3605  C_GCAxxG_C_C family protein  31.62 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1171  C_GCAxxG_C_C family protein  31.63 
 
 		 257 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.592413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1471  C_GCAxxG_C_C family protein  28.15 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1578  hypothetical protein  28.85 
 
 		 150 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.605643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1476  C_GCAxxG_C_C family protein  25.35 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1313  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.000167692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>