39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2542 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2542  protein of unknown function DUF116  100 
 
 
232 aa  463  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1841  hypothetical protein  57.33 
 
 
237 aa  297  9e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.242761  normal  0.999986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1695  hypothetical protein  53.65 
 
 
234 aa  267  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0624  hypothetical protein  51.85 
 
 
230 aa  246  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.381935  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0977  hypothetical protein  52.38 
 
 
245 aa  228  6e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.310915  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0126  hypothetical protein  47.5 
 
 
177 aa  168  6e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1513  hypothetical protein  29.7 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0687908  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0788  hypothetical protein  29.31 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1162  hypothetical protein  29.05 
 
 
214 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1167  hypothetical protein  28.82 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2439  hypothetical protein  31.85 
 
 
208 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2438  hypothetical protein  32.46 
 
 
211 aa  93.2  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1600  hypothetical protein  28.74 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1003  hypothetical protein  27.33 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1601  hypothetical protein  26.21 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0899  hypothetical protein  28.76 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.613511  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0013  protein of unknown function DUF116  26.29 
 
 
291 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.877315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2915  protein of unknown function DUF116  30.86 
 
 
634 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1706  hypothetical protein  20.99 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1335  protein of unknown function DUF116  25.55 
 
 
269 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0220692  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2312  protein of unknown function DUF116  22.84 
 
 
262 aa  62  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  hitchhiker  0.00168334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2842  protein of unknown function DUF116  22.53 
 
 
268 aa  62  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1530  protein of unknown function DUF116  22.75 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0243  hypothetical protein  24.48 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2041  protein of unknown function DUF116  21.78 
 
 
354 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0031  hypothetical protein  22 
 
 
307 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0569  hypothetical protein  25.37 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000609757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3218  protein of unknown function DUF116  21.03 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1230  hypothetical protein  23.48 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00155832  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0149  hypothetical protein  23.81 
 
 
267 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.691923  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0512  hypothetical protein  20.21 
 
 
258 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1754  hypothetical protein  21.43 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0636  protein of unknown function DUF116  19.46 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.62091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0131  hypothetical protein  20.75 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0017  protein of unknown function DUF116  20.55 
 
 
298 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0650  protein of unknown function DUF116  18.79 
 
 
256 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03585e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0820  hypothetical protein  22.3 
 
 
256 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3340  hypothetical protein  22.66 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0015  hypothetical protein  28.68 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>