145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2508 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2508  protein of unknown function DUF35  100 
 
 		 132 aa  273  6e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.347955  normal  0.395372 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2363  hypothetical protein  70.77 
 
 		 130 aa  204  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  66.92 
 
 		 130 aa  196  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1392  hypothetical protein  60.94 
 
 		 152 aa  179  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  62.02 
 
 		 130 aa  173  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  60.94 
 
 		 129 aa  173  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1934  hypothetical protein  58.78 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108502  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0549  hypothetical protein  58.59 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  53.49 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  52.71 
 
 		 130 aa  153  8e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  52.71 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  48.41 
 
 		 129 aa  144  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  46.27 
 
 		 134 aa  133  9e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  46.83 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0766  hypothetical protein  40.16 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.48862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0428  hypothetical protein  36.43 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0261769  normal  0.146814 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1241  hypothetical protein  34.62 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0148077  normal  0.0127741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1357  hypothetical protein  36.72 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0812  hypothetical protein  34.92 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.553396  hitchhiker  0.000113363 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  34.62 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1083  hypothetical protein  37.8 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0794  hypothetical protein  34.92 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0984  hypothetical protein  36.09 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1145  protein of unknown function DUF35  35.88 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0574924  hitchhiker  0.0000746026 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  29.27 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  39.09 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  34.23 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1438  3-hydroxybutyryl-CoA epimerase  34.38 
 
 		 576 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410853  normal  0.0151032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1925  protein of unknown function DUF35  35.04 
 
 		 474 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  39.53 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  39.53 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  39.53 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  32.99 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  40.4 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3871  hypothetical protein  29.46 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  33.04 
 
 		 319 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  37.37 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  30.97 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  35.9 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  32.46 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  29.06 
 
 		 311 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4021  protein of unknown function DUF35  31.88 
 
 		 481 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.605764  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  29.41 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0674  protein of unknown function DUF35  30 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  33.64 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  34.04 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  28.32 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  31.09 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  31.96 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  32.11 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  30.16 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  28.87 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  33.01 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  31.43 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000923569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  29.73 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  33.65 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  30.48 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  27.97 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4422  protein of unknown function DUF35  30.66 
 
 		 474 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00766931  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  30.28 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  28.72 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  31.73 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  32.95 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2808  protein of unknown function DUF35  32.32 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0884467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  29.52 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  31.73 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  35.19 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  24.18 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  27.27 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  31.73 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  29.57 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  33.67 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4194  protein of unknown function DUF35  27.94 
 
 		 473 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.492043  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  27.43 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  30.91 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  35.11 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  28.18 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  31.73 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4005  hypothetical protein  31 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.214613  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  31.37 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  33.68 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3973  hypothetical protein  30.77 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3818  protein of unknown function DUF35  28.83 
 
 		 320 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1005  protein of unknown function DUF35  33.66 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.966695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  29.09 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2055  protein of unknown function DUF35  31.68 
 
 		 474 aa  47  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0203372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  28.04 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  31.68 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.68 
 
 		 541 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>