61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2466 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2466  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  714    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0570  hypothetical protein  33.71 
 
 
359 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2709  membrane protein-like protein  38.75 
 
 
631 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399622  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3629  membrane protein  34.25 
 
 
647 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716701  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3465  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  36 
 
 
660 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.487354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2059  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  33.77 
 
 
657 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000771664  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  32.24 
 
 
708 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.97 
 
 
746 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2001  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.87 
 
 
756 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0304152  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36930  predicted membrane protein  31.51 
 
 
650 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0672336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.57 
 
 
719 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1143  hypothetical protein  26.52 
 
 
352 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602769  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2548  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.51 
 
 
691 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.678112 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3048  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  30.08 
 
 
740 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.532486 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  27.73 
 
 
600 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  33.56 
 
 
721 aa  54.7  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3703  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.94 
 
 
706 aa  53.1  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0284  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.36 
 
 
744 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1602  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.7 
 
 
737 aa  52.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3131  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  35.1 
 
 
738 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.861685  normal  0.88928 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0247  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.22 
 
 
706 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  26.71 
 
 
367 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3946  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.22 
 
 
706 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  25.68 
 
 
659 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28 
 
 
746 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2765  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  35.1 
 
 
738 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.617524 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2375  integral membrane protein, YccS/YhfK family  27.59 
 
 
727 aa  50.4  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2704  membrane protein-like protein  27.1 
 
 
655 aa  50.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00615533  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1207  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.95 
 
 
688 aa  50.1  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00411304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0067  hypothetical protein  33.06 
 
 
364 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.396841  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2888  YccS/YhfK family integral membrane protein  30.14 
 
 
727 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2889  hypothetical protein  34.9 
 
 
740 aa  49.3  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.777719  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  31.16 
 
 
534 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1114  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.69 
 
 
699 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3399  hypothetical protein  27.69 
 
 
700 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709327  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  29.11 
 
 
720 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4581  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.57 
 
 
696 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.271308  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01106  hypothetical protein  27.08 
 
 
680 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  27.75 
 
 
717 aa  47.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2655  hypothetical protein  28.87 
 
 
650 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2501  hypothetical protein  23.92 
 
 
371 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0697497  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3032  hypothetical protein  30.92 
 
 
770 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0228594  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  29.2 
 
 
717 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2243  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  32.26 
 
 
768 aa  46.2  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.446776  hitchhiker  0.00000657541 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3785  YccS/YhfK family integral membrane protein  28.47 
 
 
695 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0235879  hitchhiker  0.00807604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3344  hypothetical protein  28.28 
 
 
632 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000196875  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30590  hypothetical protein  24.62 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05690  Integral membrane protein, YccS/YhfK family  32.2 
 
 
724 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3187  hypothetical protein  35.83 
 
 
790 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2959  hypothetical protein  30.83 
 
 
371 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569097  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6403  cyclic nucleotide-binding protein  27.59 
 
 
692 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0685  hypothetical protein  30.21 
 
 
354 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.34 
 
 
745 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1387  hypothetical protein  31.2 
 
 
357 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669214  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3567  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.46 
 
 
746 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3511  hypothetical protein  24.79 
 
 
375 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26710  hypothetical protein  28.28 
 
 
450 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4661  hypothetical protein  25.62 
 
 
776 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.415956  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  25.78 
 
 
764 aa  43.1  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  30.14 
 
 
733 aa  43.1  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1365  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.68 
 
 
744 aa  43.1  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>