More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2447 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2447  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 404 aa  838    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  78.35 
 
 		 397 aa  643    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627883  normal  0.114267 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0693  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  68.55 
 
 		 379 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  69.17 
 
 		 379 aa  538  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12642  ornithine decarboxylase 2  36.6 
 
 		 390 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3803  Ornithine decarboxylase  33.06 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.390604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.16 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0274  ornithine decarboxylase  32.46 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000805907  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.51 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3234  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.49 
 
 		 433 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  32.98 
 
 		 400 aa  192  9e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.6 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90612  ornithine decarboxylase  31.65 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.253647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.6 
 
 		 388 aa  186  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0531  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.9 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.077204  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.13 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03846  ornithine decarboxylase (Eurofung)  31.9 
 
 		 434 aa  179  8e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000212473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2715  ornithine decarboxylase  32.88 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2057  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.45 
 
 		 376 aa  172  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4837  ornithine decarboxylase  32.88 
 
 		 380 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0856  ornithine decarboxylase  32.08 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12320  Ornithine decarboxylase  32.71 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4547  ornithine decarboxylase  32.61 
 
 		 380 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04890  ornithine decarboxylase, putative  30.37 
 
 		 527 aa  169  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.447794  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1333  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.4 
 
 		 386 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000335599  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0938  Ornithine decarboxylase  31.81 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0801  ornithine decarboxylase  32.53 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0100  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  32.6 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.938006  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0092  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  32.6 
 
 		 377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0077  ornithine decarboxylase  32.8 
 
 		 391 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3689  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.23 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192406  normal  0.735507 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1090  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.41 
 
 		 377 aa  166  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0029  ornithine decarboxylase  32.11 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0801  ornithine decarboxylase  32.05 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3806  ornithine decarboxylase  31.23 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.16357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1693  ornithine decarboxylase  33.33 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3390  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.96 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3392  ornithine decarboxylase  31.51 
 
 		 391 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000026968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4314  ornithine decarboxylase  31.68 
 
 		 387 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0146694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0908  ornithine decarboxylase  31.23 
 
 		 387 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0037  ornithine decarboxylase  31.85 
 
 		 391 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1080  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.47 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0894  ornithine decarboxylase  30.95 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.199626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1157  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.05 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0864  ornithine decarboxylase  31.41 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  32.12 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2175  ornithine decarboxylase  32.29 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174065 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4245  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.23 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4655  ornithine decarboxylase  32.47 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.203932 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3507  ornithine decarboxylase  30.73 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00021864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4136  decarboxylase, pyridoxal-dependent  30.39 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3682  ornithine decarboxylase  30.47 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00110632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2772  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.41 
 
 		 377 aa  160  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0445  ornithine decarboxylase  30.47 
 
 		 391 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00713541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2177  ornithine decarboxylase  31.82 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.024937  normal  0.209204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1649  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.55 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.648031  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3110  ornithine decarboxylase  31.71 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0541  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 		 391 aa  159  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3405  diaminopimelate decarboxylase  30.13 
 
 		 391 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5654  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.42 
 
 		 397 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0489  Diaminopimelate decarboxylase  30.13 
 
 		 391 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4247  ornithine decarboxylase  31.5 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0465  diaminopimelate decarboxylase  30.13 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0486  diaminopimelate decarboxylase  30.13 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000602971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3854  diaminopimelate decarboxylase  30.13 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000739123  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5135  ornithine decarboxylase  31.23 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2895  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.42 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922142 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3419  ornithine decarboxylase  30.91 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268803  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.18 
 
 		 380 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.215223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2006  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.35 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58630  ornithine decarboxylase  30.63 
 
 		 387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2045  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.03 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0410  ornithine decarboxylase  30.39 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3075  diaminopimelate decarboxylase  30.59 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000605202  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2320  Ornithine decarboxylase  30.03 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  0.55371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1349  ornithine decarboxylase  32.53 
 
 		 380 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4572  pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain protein  31.98 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0801  ornithine decarboxylase  30.98 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31322  Ornithine decarboxylase  28.18 
 
 		 547 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0025491  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0446  ornithine decarboxylase  30.89 
 
 		 390 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5043  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.03 
 
 		 403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2180  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.71 
 
 		 376 aa  147  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0693915  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0377  ornithine decarboxylase  32.54 
 
 		 417 aa  146  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.412388  normal  0.928081 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1375  ornithine decarboxylase  31.81 
 
 		 398 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0576  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.67 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  29.29 
 
 		 392 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  29.2 
 
 		 457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24620  ornithine decarboxylase  31.25 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2321  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.28 
 
 		 387 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671563  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0258  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.6 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135065 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  29.9 
 
 		 416 aa  129  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2027  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.75 
 
 		 406 aa  129  6e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  30.43 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  26.79 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3089  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.97 
 
 		 381 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  31.62 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1991  putative ornithine decarboxylase  29.72 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0701  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.72 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1794  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.71 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  30.48 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>