More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2268 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  100 
 
 
145 aa  297  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  60.71 
 
 
165 aa  174  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  58.27 
 
 
139 aa  165  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  62.02 
 
 
181 aa  164  3e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  54.35 
 
 
154 aa  159  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  56.2 
 
 
139 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  54.35 
 
 
154 aa  159  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  56.2 
 
 
145 aa  158  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  53.57 
 
 
150 aa  157  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  51.8 
 
 
146 aa  157  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  54.68 
 
 
150 aa  156  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  54.01 
 
 
148 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  55.47 
 
 
149 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  55.47 
 
 
145 aa  154  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
147 aa  153  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  54.29 
 
 
150 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  54.29 
 
 
150 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  54.29 
 
 
150 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  52.17 
 
 
145 aa  152  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  54.29 
 
 
150 aa  152  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  54.29 
 
 
150 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  54.29 
 
 
150 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  54.29 
 
 
150 aa  152  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.35 
 
 
146 aa  151  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  52.52 
 
 
148 aa  151  3e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  53.57 
 
 
150 aa  150  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  53.79 
 
 
146 aa  150  6e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  54.68 
 
 
148 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  51.08 
 
 
148 aa  148  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  54.74 
 
 
144 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  52.17 
 
 
143 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
146 aa  147  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2817  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
148 aa  145  2e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
148 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
147 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
147 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  51.77 
 
 
145 aa  142  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  50.36 
 
 
148 aa  141  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  49.64 
 
 
146 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  51.82 
 
 
148 aa  139  1e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  53.33 
 
 
144 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  50.36 
 
 
153 aa  137  4e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  49.64 
 
 
146 aa  136  9e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  48.91 
 
 
149 aa  134  3e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  48.91 
 
 
147 aa  133  6e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  48.91 
 
 
147 aa  133  6e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4470  response regulator receiver protein  50 
 
 
148 aa  134  6e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  48.91 
 
 
147 aa  133  6e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  48.18 
 
 
146 aa  132  1e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  48.55 
 
 
144 aa  129  2e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4222  response regulator receiver protein  43.07 
 
 
144 aa  124  4e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  45.26 
 
 
150 aa  122  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2303  response regulator receiver protein  43.51 
 
 
151 aa  121  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  44.37 
 
 
151 aa  120  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1095  response regulator receiver protein  42.45 
 
 
171 aa  120  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  44.29 
 
 
150 aa  119  1e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  45.52 
 
 
149 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0782  response regulator receiver protein  43.17 
 
 
160 aa  114  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00636968  normal  0.0949177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  43.17 
 
 
151 aa  112  2e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0524  response regulator receiver protein  41.04 
 
 
155 aa  111  4e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  38.64 
 
 
146 aa  110  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  45.38 
 
 
162 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  44.44 
 
 
167 aa  110  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  43.26 
 
 
149 aa  108  2e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2726  response regulator receiver protein  43.85 
 
 
145 aa  107  4e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0749  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
156 aa  107  4e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  40 
 
 
143 aa  107  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  41.61 
 
 
153 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
152 aa  107  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1954  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
151 aa  107  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  43.18 
 
 
151 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  44.62 
 
 
162 aa  106  9e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  41.13 
 
 
148 aa  105  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0458  response regulator receiver  38.69 
 
 
151 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  42.14 
 
 
153 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  42.96 
 
 
146 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3985  response regulator receiver protein  41.3 
 
 
152 aa  105  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  43.85 
 
 
153 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  40.48 
 
 
152 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
148 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4530  response regulator receiver protein  43.51 
 
 
146 aa  103  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2026  response regulator receiver protein  43.51 
 
 
154 aa  103  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  41.35 
 
 
148 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  42.31 
 
 
160 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
146 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
145 aa  101  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  43.08 
 
 
153 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  43.18 
 
 
153 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  42.75 
 
 
146 aa  100  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3261  response regulator  42.03 
 
 
150 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  42.45 
 
 
147 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  41.54 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2355  response regulator receiver protein  41.54 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.484722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  41.54 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  42.54 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1955  response regulator receiver protein  41.54 
 
 
153 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.205931  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  40.58 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.02211e-09  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  41.48 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  40.77 
 
 
164 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  41.48 
 
 
152 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0271352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>