More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2253 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  47.93 
 
 
751 aa  659    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.4 
 
 
773 aa  740    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
753 aa  1529    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  43.85 
 
 
738 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.45 
 
 
762 aa  589  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
764 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.5 
 
 
764 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.84 
 
 
764 aa  505  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.75 
 
 
1053 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  39.56 
 
 
862 aa  504  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.94 
 
 
959 aa  504  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  38.84 
 
 
764 aa  505  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  38.93 
 
 
986 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.18 
 
 
868 aa  490  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000944502  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  36.23 
 
 
912 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
685 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  40.93 
 
 
798 aa  471  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  40.93 
 
 
804 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.95 
 
 
962 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.93 
 
 
1086 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  39.94 
 
 
761 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  38.64 
 
 
795 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.52 
 
 
778 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.97 
 
 
763 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.97 
 
 
802 aa  458  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  36.99 
 
 
833 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.74 
 
 
848 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.47 
 
 
973 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.8 
 
 
815 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.72 
 
 
764 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.74 
 
 
807 aa  452  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.75 
 
 
807 aa  441  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.66 
 
 
781 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.94 
 
 
941 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.71 
 
 
775 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.69 
 
 
815 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.78 
 
 
790 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.39 
 
 
782 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.03 
 
 
824 aa  434  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.23 
 
 
972 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.46 
 
 
751 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  38.35 
 
 
780 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.14 
 
 
739 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  36.15 
 
 
795 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  38.16 
 
 
865 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.45 
 
 
1198 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.69 
 
 
812 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.28 
 
 
806 aa  425  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.04 
 
 
775 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.82 
 
 
804 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.04 
 
 
775 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.18 
 
 
761 aa  422  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.49 
 
 
752 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.56 
 
 
758 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.93 
 
 
775 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  33.17 
 
 
815 aa  419  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  37.3 
 
 
771 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.05 
 
 
861 aa  402  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  36.6 
 
 
797 aa  401  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.2 
 
 
789 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.69 
 
 
759 aa  399  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.79 
 
 
855 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.25 
 
 
803 aa  392  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.75 
 
 
790 aa  390  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.84 
 
 
807 aa  392  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  32.93 
 
 
891 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.24 
 
 
768 aa  388  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.65 
 
 
829 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  33.73 
 
 
831 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.24 
 
 
805 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.71 
 
 
896 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34 
 
 
808 aa  353  7e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.98 
 
 
868 aa  353  8.999999999999999e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.02 
 
 
766 aa  342  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  30.93 
 
 
1210 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.27 
 
 
803 aa  327  6e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  33.19 
 
 
758 aa  324  5e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  29.98 
 
 
948 aa  316  9e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  30.57 
 
 
931 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  37.24 
 
 
866 aa  304  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  0.000025981 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.15 
 
 
744 aa  297  6e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.71 
 
 
902 aa  291  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.56 
 
 
897 aa  282  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.68 
 
 
744 aa  272  2e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.36 
 
 
756 aa  267  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.26 
 
 
744 aa  266  1e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
744 aa  264  6e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.41 
 
 
838 aa  256  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.01 
 
 
739 aa  252  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.97 
 
 
751 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.67 
 
 
815 aa  242  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  27.2 
 
 
1178 aa  241  2.9999999999999997e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.28 
 
 
740 aa  235  3e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  26.87 
 
 
905 aa  232  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.28 
 
 
876 aa  213  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.09 
 
 
914 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.99 
 
 
911 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  27.11 
 
 
906 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.54 
 
 
879 aa  157  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  25.36 
 
 
1321 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>