More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2206 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2206  histidinol dehydrogenase  100 
 
 
416 aa  842    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2149  histidinol dehydrogenase  72.12 
 
 
426 aa  628  1e-179  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.547932  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1876  histidinol dehydrogenase  70.6 
 
 
416 aa  608  1e-173  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.963985  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2531  histidinol dehydrogenase  65.78 
 
 
442 aa  565  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.742259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0461  histidinol dehydrogenase  67.33 
 
 
403 aa  560  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0843  histidinol dehydrogenase  54.9 
 
 
426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.567726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3507  histidinol dehydrogenase  54.43 
 
 
433 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.044382  normal  0.441151 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1103  histidinol dehydrogenase  52.51 
 
 
426 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000289644  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1963  histidinol dehydrogenase  45.63 
 
 
424 aa  361  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15280  histidinol dehydrogenase  50.24 
 
 
457 aa  359  5e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0769974 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1687  histidinol dehydrogenase  48.4 
 
 
424 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0791  histidinol dehydrogenase  48.15 
 
 
424 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.139873  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0863  histidinol dehydrogenase  47.69 
 
 
426 aa  354  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.998875  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0213  histidinol dehydrogenase  49.14 
 
 
424 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.314414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1001  histidinol dehydrogenase  46 
 
 
427 aa  348  8e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2175  histidinol dehydrogenase  47.24 
 
 
428 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2355  histidinol dehydrogenase  47.3 
 
 
430 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0263809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3100  histidinol dehydrogenase  46.4 
 
 
429 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2785  histidinol dehydrogenase  46.13 
 
 
437 aa  345  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0382  histidinol dehydrogenase  45.61 
 
 
434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1526  histidinol dehydrogenase  46.35 
 
 
429 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0291  histidinol dehydrogenase  47.91 
 
 
425 aa  343  4e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0634762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0384  histidinol dehydrogenase  45.43 
 
 
436 aa  343  4e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2882  histidinol dehydrogenase  48.5 
 
 
435 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01831  histidinol dehydrogenase  45.23 
 
 
436 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1290  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
429 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1291  histidinol dehydrogenase  45.84 
 
 
429 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1497  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
429 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2478  histidinol dehydrogenase  47.55 
 
 
425 aa  341  2e-92  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3885  histidinol dehydrogenase  46.35 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003848  histidinol dehydrogenase  44.29 
 
 
430 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3156  histidinol dehydrogenase  47.21 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0450  histidinol dehydrogenase  46.31 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.722983  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1125  Histidinol dehydrogenase  47.36 
 
 
428 aa  338  7e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.820972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02200  Histidinol dehydrogenase  46.72 
 
 
427 aa  338  8e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1317  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1459  histidinol dehydrogenase  45.84 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1426  histidinol dehydrogenase  45.59 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1627  histidinol dehydrogenase  50 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1565  histidinol dehydrogenase  46.35 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1328  histidinol dehydrogenase  45.11 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09011  putative histidinol dehydrogenase  41.29 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3799  histidinol dehydrogenase  45.75 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0752  histidinol dehydrogenase  48.84 
 
 
432 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1129  histidinol dehydrogenase  46.1 
 
 
427 aa  335  7e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1134  histidinol dehydrogenase  42.62 
 
 
431 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1492  histidinol dehydrogenase  45.02 
 
 
426 aa  333  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.177754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3042  histidinol dehydrogenase  47.5 
 
 
430 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0670659  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1141  histidinol dehydrogenase  45.36 
 
 
422 aa  333  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517537  normal  0.0197724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3704  histidinol dehydrogenase  45.41 
 
 
429 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5103  histidinol dehydrogenase  45.69 
 
 
436 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.846719  normal  0.293157 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1079  histidinol dehydrogenase  47.84 
 
 
452 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.156485  hitchhiker  0.0000000000192016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0023  histidinol dehydrogenase  47.78 
 
 
435 aa  332  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2942  histidinol dehydrogenase  46.37 
 
 
454 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.795445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0659  histidinol dehydrogenase  45.72 
 
 
433 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2979  histidinol dehydrogenase  47.57 
 
 
422 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0128196  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0703  histidinol dehydrogenase  44.47 
 
 
431 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0822  histidinol dehydrogenase  46.78 
 
 
432 aa  331  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000181835  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0326  histidinol dehydrogenase  48.89 
 
 
430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0602  histidinol dehydrogenase  45.97 
 
 
446 aa  329  5.0000000000000004e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1768  histidinol dehydrogenase  44.36 
 
 
432 aa  329  5.0000000000000004e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.300767  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0668  histidinol dehydrogenase  48.21 
 
 
445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.180765  normal  0.612492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1818  histidinol dehydrogenase  43.5 
 
 
429 aa  328  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1959  histidinol dehydrogenase  48.41 
 
 
436 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2877  histidinol dehydrogenase  41.93 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.612016  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1519  histidinol dehydrogenase  45.19 
 
 
434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4057  histidinol dehydrogenase  44.58 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309263  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0270  histidinol dehydrogenase  48.28 
 
 
430 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000026667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0252  histidinol dehydrogenase  48.28 
 
 
430 aa  326  6e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4204  histidinol dehydrogenase  46.46 
 
 
433 aa  325  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.536856 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1869  histidinol dehydrogenase  47.78 
 
 
432 aa  324  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3170  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 
443 aa  324  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.992848 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2429  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 
443 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2526  histidinol dehydrogenase  42.75 
 
 
443 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1861  histidinol dehydrogenase  41.75 
 
 
428 aa  324  2e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0521  histidinol dehydrogenase  46.59 
 
 
431 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.253897 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2688  histidinol dehydrogenase  45.39 
 
 
431 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2035  histidinol dehydrogenase  45.71 
 
 
424 aa  322  7e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1020  histidinol dehydrogenase  45.71 
 
 
441 aa  322  9.000000000000001e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473848  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1337  histidinol dehydrogenase  42.86 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2330  histidinol dehydrogenase  43.88 
 
 
436 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0874985  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2070  histidinol dehydrogenase  45.25 
 
 
435 aa  319  6e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2198  histidinol dehydrogenase  42.92 
 
 
443 aa  319  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0308106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5022  histidinol dehydrogenase  45.32 
 
 
431 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0313  histidinol dehydrogenase  46.15 
 
 
425 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1656  histidinol dehydrogenase  42.21 
 
 
435 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.554535  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2632  histidinol dehydrogenase  42.67 
 
 
434 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1898  Histidinol dehydrogenase  43.6 
 
 
428 aa  316  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1212  histidinol dehydrogenase  42.64 
 
 
434 aa  315  7e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0286  histidinol dehydrogenase  45.95 
 
 
431 aa  315  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1554  histidinol dehydrogenase  45.66 
 
 
425 aa  315  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01908  hypothetical protein  42.64 
 
 
434 aa  315  8e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01922  histidinol dehydrogenase  42.64 
 
 
413 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01117  Histidinol dehydrogenase  42.06 
 
 
434 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0497  histidinol dehydrogenase  40.96 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1637  Histidinol dehydrogenase  42.64 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140746  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1019  histidinol dehydrogenase  43.98 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0513  histidinol dehydrogenase  42.93 
 
 
428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.536142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2311  histidinol dehydrogenase  42.39 
 
 
434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.6226  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2228  histidinol dehydrogenase  43.91 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>