More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2070 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 
802 aa  1616    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  71.86 
 
 
719 aa  915    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  67.11 
 
 
823 aa  983    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  60.56 
 
 
845 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  78.73 
 
 
870 aa  589  1e-167  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  56.65 
 
 
840 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  50.1 
 
 
3295 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1732 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  70.95 
 
 
819 aa  397  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  66.19 
 
 
786 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  73.18 
 
 
777 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  89.03 
 
 
1356 aa  295  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  85.33 
 
 
1380 aa  279  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  34.87 
 
 
1387 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  45.03 
 
 
2554 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  40.28 
 
 
1094 aa  234  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  42.27 
 
 
1667 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  40.79 
 
 
735 aa  228  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.58 
 
 
859 aa  228  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  37.95 
 
 
2122 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  40.53 
 
 
713 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  40.47 
 
 
669 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  41.69 
 
 
2036 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40.12 
 
 
752 aa  220  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  39.73 
 
 
1842 aa  217  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  42.98 
 
 
930 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.53 
 
 
679 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  40.18 
 
 
561 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  41.62 
 
 
575 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40.65 
 
 
2272 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  38.96 
 
 
1300 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.77 
 
 
1282 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  38.74 
 
 
2000 aa  212  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.2 
 
 
1882 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  39.05 
 
 
675 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  39.18 
 
 
1862 aa  209  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  40.6 
 
 
1682 aa  208  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.53 
 
 
685 aa  207  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  38.69 
 
 
528 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  38.26 
 
 
861 aa  204  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  46.15 
 
 
530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.53 
 
 
1361 aa  202  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  39.27 
 
 
1241 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  39.12 
 
 
978 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  40.41 
 
 
1969 aa  197  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  36.68 
 
 
963 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  39.17 
 
 
658 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.04 
 
 
838 aa  194  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  43.44 
 
 
1120 aa  193  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  44.21 
 
 
547 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  41.32 
 
 
551 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  38.61 
 
 
460 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  42.61 
 
 
958 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  43.57 
 
 
791 aa  187  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  42.74 
 
 
581 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  35.97 
 
 
1528 aa  184  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  38.66 
 
 
941 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.83 
 
 
1667 aa  181  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  41.18 
 
 
1236 aa  181  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  41.88 
 
 
910 aa  179  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.29 
 
 
615 aa  177  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  36.69 
 
 
869 aa  171  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  45.88 
 
 
735 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  40.08 
 
 
930 aa  160  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  52.02 
 
 
627 aa  158  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  53.25 
 
 
581 aa  156  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  37.47 
 
 
971 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 
1234 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  53.42 
 
 
1799 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  42.5 
 
 
848 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  43.32 
 
 
2552 aa  147  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  51.28 
 
 
1262 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  44.39 
 
 
930 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  31.67 
 
 
952 aa  142  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  48.43 
 
 
522 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  45.68 
 
 
184 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  40.59 
 
 
644 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  45.51 
 
 
966 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  37.01 
 
 
1292 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  35.37 
 
 
443 aa  134  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  43.09 
 
 
954 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  38.11 
 
 
1095 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  44.21 
 
 
816 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  31.36 
 
 
929 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  33.24 
 
 
2176 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  45.16 
 
 
1931 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  51.37 
 
 
1035 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  43.01 
 
 
468 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  44.38 
 
 
560 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  48.25 
 
 
519 aa  127  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  34.54 
 
 
1783 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  36.02 
 
 
1189 aa  126  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  37.92 
 
 
938 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  47.22 
 
 
749 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  47.37 
 
 
919 aa  124  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  42 
 
 
1311 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  43.53 
 
 
684 aa  122  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  42.05 
 
 
739 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 
627 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  28.5 
 
 
1011 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>