More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2068 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  71.39 
 
 		 1732 aa  962    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  72.18 
 
 		 2554 aa  857    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  71.91 
 
 		 1380 aa  744    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  75.1 
 
 		 3295 aa  655    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1356 aa  2668    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  41.53 
 
 		 2272 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  50.7 
 
 		 1842 aa  498  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  40.21 
 
 		 1094 aa  486  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  37.71 
 
 		 1862 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  47.73 
 
 		 1361 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  51.53 
 
 		 870 aa  466  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  47.72 
 
 		 840 aa  466  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  43.23 
 
 		 1682 aa  465  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  45.45 
 
 		 845 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  49.11 
 
 		 978 aa  457  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.31 
 
 		 1282 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  55.05 
 
 		 2036 aa  436  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  55.43 
 
 		 1882 aa  433  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  37.56 
 
 		 1667 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  53.32 
 
 		 575 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  55.53 
 
 		 2122 aa  422  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  53.33 
 
 		 528 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  46.28 
 
 		 752 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  45.01 
 
 		 963 aa  415  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  54.55 
 
 		 2000 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  51.35 
 
 		 735 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.26 
 
 		 819 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  51.05 
 
 		 561 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  49.88 
 
 		 530 aa  375  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  37.91 
 
 		 838 aa  361  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  38.87 
 
 		 941 aa  360  9.999999999999999e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  56.12 
 
 		 1300 aa  353  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  33.65 
 
 		 1387 aa  347  6e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  54.52 
 
 		 1120 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  53.74 
 
 		 1969 aa  343  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  37.08 
 
 		 1528 aa  338  5e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  53.75 
 
 		 669 aa  333  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  53.61 
 
 		 675 aa  332  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  53.59 
 
 		 1241 aa  331  6e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  53.15 
 
 		 713 aa  331  7e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  39.9 
 
 		 1236 aa  328  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  52.71 
 
 		 679 aa  328  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  51.81 
 
 		 859 aa  325  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  52.11 
 
 		 685 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  54.22 
 
 		 658 aa  319  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  49.87 
 
 		 777 aa  318  3e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  50.37 
 
 		 930 aa  317  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  46.78 
 
 		 958 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  54.46 
 
 		 460 aa  315  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.04 
 
 		 786 aa  314  6.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.38 
 
 		 1667 aa  313  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  38.5 
 
 		 719 aa  311  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  72.17 
 
 		 802 aa  295  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  71.03 
 
 		 823 aa  294  9e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  54.63 
 
 		 910 aa  283  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  49.56 
 
 		 861 aa  280  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  55.73 
 
 		 547 aa  263  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  35.9 
 
 		 1011 aa  262  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  55.25 
 
 		 581 aa  261  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  53.23 
 
 		 615 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  54.62 
 
 		 551 aa  255  3e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  53.04 
 
 		 791 aa  247  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.51 
 
 		 971 aa  247  9e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.44 
 
 		 869 aa  234  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  33.44 
 
 		 2176 aa  233  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  34.7 
 
 		 1814 aa  232  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  32.01 
 
 		 952 aa  225  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  31.17 
 
 		 1783 aa  223  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  43.59 
 
 		 443 aa  216  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  31.17 
 
 		 865 aa  215  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  40 
 
 		 1292 aa  204  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  49.59 
 
 		 2552 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  56.44 
 
 		 848 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  46.35 
 
 		 1095 aa  192  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  45.51 
 
 		 930 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  39.31 
 
 		 966 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  45.91 
 
 		 938 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  47.03 
 
 		 644 aa  182  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  54.07 
 
 		 560 aa  180  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.99 
 
 		 439 aa  179  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  35.78 
 
 		 1531 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.75 
 
 		 1606 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  49.72 
 
 		 184 aa  174  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  56.94 
 
 		 735 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  39.3 
 
 		 821 aa  161  9e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  57.23 
 
 		 940 aa  160  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.57 
 
 		 929 aa  159  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  37.74 
 
 		 1189 aa  158  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  54.79 
 
 		 1799 aa  157  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  52.87 
 
 		 581 aa  156  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  48.44 
 
 		 519 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  34.35 
 
 		 1987 aa  154  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  49.5 
 
 		 819 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  49.7 
 
 		 627 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  44.86 
 
 		 1234 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  44.22 
 
 		 500 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  48.52 
 
 		 816 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.77 
 
 		 1602 aa  147  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  46.33 
 
 		 1931 aa  147  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  49.43 
 
 		 1231 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>