More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2064 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  70.35 
 
 		 864 aa  1330    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 906 aa  785    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 886 aa  776    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 863 aa  1800    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 869 aa  1002    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  71.83 
 
 		 863 aa  1321    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  68.68 
 
 		 865 aa  1266    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 865 aa  1204    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 886 aa  758    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 865 aa  1016    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 886 aa  780    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  55.43 
 
 		 855 aa  976    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 809 aa  723    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 886 aa  780    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 858 aa  630  1e-179  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 896 aa  555  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 905 aa  552  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 928 aa  535  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  35.02 
 
 		 892 aa  520  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 816 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 802 aa  508  9.999999999999999e-143  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 808 aa  492  1e-137  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 808 aa  491  1e-137  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 771 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 864 aa  463  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 799 aa  465  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.95 
 
 		 886 aa  465  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 799 aa  464  1e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 799 aa  462  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 799 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  35.07 
 
 		 846 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 806 aa  449  1e-125  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  33.5 
 
 		 861 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  33.83 
 
 		 881 aa  442  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 894 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 906 aa  441  9.999999999999999e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.29 
 
 		 836 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 845 aa  439  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 901 aa  434  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  34.81 
 
 		 858 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  33.45 
 
 		 916 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1473  valyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 881 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000014278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  33.37 
 
 		 911 aa  435  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3348  valyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 881 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000651158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  33.25 
 
 		 895 aa  432  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 855 aa  431  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  33.26 
 
 		 925 aa  432  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 885 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 		 902 aa  432  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 876 aa  429  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2175  valyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 880 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1886  valyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 		 880 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 882 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 		 880 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1004  valyl-tRNA synthetase  33.16 
 
 		 865 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.15649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1102  valyl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 865 aa  420  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0575058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 860 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1649  valyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 883 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 885 aa  416  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  33.5 
 
 		 877 aa  411  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1090  valyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 881 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0316767  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 877 aa  411  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 882 aa  409  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2554  valyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 879 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0681361  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0430  valyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 		 880 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.029099  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0950  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 883 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1831  valyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 881 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0410147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 		 903 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 872 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  34.45 
 
 		 873 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0407  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 880 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0922688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  33.42 
 
 		 862 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1729  valyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 884 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 		 891 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1491  valyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 874 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1483  valyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 891 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0324  valyl-tRNA synthetase  33.07 
 
 		 884 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 871 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0343  valyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 867 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4361  valyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 		 881 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000840435  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_372  valyl-tRNA synthetase  33.29 
 
 		 880 aa  398  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0207996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1199  valyl-tRNA synthetase  33.15 
 
 		 883 aa  399  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.842329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2211  valyl-tRNA synthetase  32.03 
 
 		 879 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00320783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1569  valyl-tRNA synthetase  30.64 
 
 		 866 aa  396  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2450  valyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 		 887 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0251  valyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 		 886 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 881 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 881 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2315  valyl-tRNA synthetase  33.24 
 
 		 885 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  33.73 
 
 		 861 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 881 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  32.29 
 
 		 881 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  32.37 
 
 		 881 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 881 aa  386  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 881 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 881 aa  386  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 		 881 aa  386  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  32.16 
 
 		 881 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2238  valyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 884 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.180056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>