More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2056 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  100 
 
 
241 aa  475  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  58.4 
 
 
242 aa  299  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  58.09 
 
 
241 aa  296  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  58.92 
 
 
241 aa  293  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30.58 
 
 
261 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.34 
 
 
254 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
289 aa  120  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.74 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  34.96 
 
 
278 aa  118  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.34 
 
 
253 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.34 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 
251 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 
256 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 
255 aa  110  3e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  34.55 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.94 
 
 
253 aa  109  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
278 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  30.62 
 
 
254 aa  108  8.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  31.12 
 
 
251 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 
278 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  30.9 
 
 
276 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.5 
 
 
249 aa  106  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 
256 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.51 
 
 
256 aa  104  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  32.68 
 
 
291 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  35.12 
 
 
296 aa  102  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  32.68 
 
 
295 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
254 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  30.42 
 
 
274 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 
256 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  30.42 
 
 
274 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 
298 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  30.42 
 
 
274 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
277 aa  99.4  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 
298 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.91 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.67 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.74 
 
 
255 aa  96.3  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  29.58 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 
298 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 
286 aa  95.5  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.05 
 
 
249 aa  95.1  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.63 
 
 
264 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  31.96 
 
 
277 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  34.63 
 
 
286 aa  92  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.43 
 
 
288 aa  91.7  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  27.12 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  34.93 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.09 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  30 
 
 
256 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.64 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
270 aa  86.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  25.74 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  33.66 
 
 
284 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 
249 aa  85.5  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.84 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  30.88 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.87 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  29.44 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.19 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  29.81 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.87 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  29.35 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3261  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24830  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1781  putative multidrug efflux ABC transporter  33.82 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3849  ABC-2 type transporter  27.45 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  33.82 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.112221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  27.5 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
280 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  30.1 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  29.17 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  30.54 
 
 
271 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>