93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2041 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  719    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  86.25 
 
 		 242 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  57.97 
 
 		 359 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  56.97 
 
 		 343 aa  392  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  57.51 
 
 		 366 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  59.75 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  60.2 
 
 		 352 aa  363  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  58.88 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  54.63 
 
 		 344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  57.68 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  51.93 
 
 		 358 aa  359  4e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  52.28 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  57.76 
 
 		 342 aa  348  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  51.38 
 
 		 334 aa  345  8e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  54.15 
 
 		 344 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  52.92 
 
 		 340 aa  340  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  53.73 
 
 		 369 aa  338  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  53.4 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  53.4 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  49.11 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  48.49 
 
 		 342 aa  335  9e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  52.66 
 
 		 342 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  51.53 
 
 		 350 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  46.59 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  50.46 
 
 		 355 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  50.46 
 
 		 355 aa  326  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  53.42 
 
 		 337 aa  324  1e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  49.07 
 
 		 342 aa  323  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  51.69 
 
 		 344 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  51.23 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  49.54 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  47.51 
 
 		 352 aa  316  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  50.99 
 
 		 356 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  46.33 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  47.08 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  46.88 
 
 		 352 aa  309  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  49.85 
 
 		 341 aa  309  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  47.08 
 
 		 353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  50.46 
 
 		 341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  49.85 
 
 		 353 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  48.38 
 
 		 336 aa  305  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  51.41 
 
 		 335 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  51.74 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  45.43 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  50.5 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  49.04 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  46.15 
 
 		 332 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  48.68 
 
 		 339 aa  288  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  43.81 
 
 		 357 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  52.86 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  46.08 
 
 		 334 aa  280  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  46.25 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  45.37 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  45.14 
 
 		 333 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  47.12 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  43.71 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  44.51 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  49.8 
 
 		 256 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  33 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  53.57 
 
 		 154 aa  134  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  50.4 
 
 		 197 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  49.59 
 
 		 141 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  50.81 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  48.76 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  47.2 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  45.97 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  46.4 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  52.99 
 
 		 126 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  50.85 
 
 		 127 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  44.09 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  47.01 
 
 		 144 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  43.08 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  40 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  40 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  39.37 
 
 		 326 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  40.16 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  42.86 
 
 		 330 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  42.86 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  35.38 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  38.93 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  37.7 
 
 		 192 aa  93.6  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  34.71 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  35.38 
 
 		 332 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  35.71 
 
 		 198 aa  89.7  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  33.9 
 
 		 135 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  52.63 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  45.57 
 
 		 105 aa  75.5  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1274  virulence protein-like protein  52.05 
 
 		 117 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  34 
 
 		 121 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  41.67 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  31.94 
 
 		 90 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  41.79 
 
 		 81 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 164 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>