28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1944 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  100 
 
 		 265 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  51.5 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  40.89 
 
 		 268 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  46.39 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  43.16 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  48.57 
 
 		 649 aa  135  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  47.1 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  48.92 
 
 		 443 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  45.89 
 
 		 540 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  40.69 
 
 		 288 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  43.24 
 
 		 456 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  45.14 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  45.14 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  36.9 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  45.26 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  39.87 
 
 		 197 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  43.8 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  44.44 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  43.07 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  42.86 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  47.83 
 
 		 195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  39.13 
 
 		 446 aa  99.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  35.8 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  31.98 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  35.57 
 
 		 268 aa  95.9  7e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  35.66 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  29.02 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  39.42 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>