More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1941 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  77.86 
 
 
394 aa  664  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  100 
 
 
394 aa  817  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  58.4 
 
 
880 aa  472  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  56.15 
 
 
393 aa  467  1e-130  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  57.65 
 
 
896 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  56.1 
 
 
885 aa  452  1e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  53.98 
 
 
878 aa  448  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  50.64 
 
 
393 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  48.08 
 
 
879 aa  401  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  47.14 
 
 
393 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  46.91 
 
 
392 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.03 
 
 
408 aa  347  1e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43 
 
 
406 aa  345  9e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.79 
 
 
406 aa  338  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.15 
 
 
412 aa  336  5e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.77 
 
 
409 aa  335  8e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  46.51 
 
 
408 aa  328  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.32 
 
 
412 aa  328  1e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.84 
 
 
415 aa  327  2e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.04 
 
 
417 aa  327  3e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  42.28 
 
 
410 aa  325  8e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.07 
 
 
412 aa  322  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.65 
 
 
408 aa  322  6e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  43 
 
 
414 aa  321  1e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  39.8 
 
 
406 aa  322  1e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.29 
 
 
406 aa  322  1e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.12 
 
 
433 aa  321  1e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  39.8 
 
 
406 aa  322  1e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  39.8 
 
 
406 aa  321  2e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  40.8 
 
 
410 aa  320  2e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.21 
 
 
414 aa  320  2e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  39.8 
 
 
406 aa  321  2e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.2 
 
 
413 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.2 
 
 
413 aa  320  3e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.56 
 
 
406 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.75 
 
 
410 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  39.56 
 
 
406 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  39.8 
 
 
406 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.08 
 
 
418 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  39.8 
 
 
406 aa  319  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  39.8 
 
 
406 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  41.62 
 
 
413 aa  318  8e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  41.75 
 
 
424 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  42.57 
 
 
405 aa  318  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.44 
 
 
414 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.79 
 
 
421 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  7.71215e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.36 
 
 
414 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.37 
 
 
443 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  42.64 
 
 
395 aa  315  1e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  39.56 
 
 
406 aa  314  1e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.49 
 
 
414 aa  312  5e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.48 
 
 
435 aa  310  2e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.9 
 
 
420 aa  310  3e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.56 
 
 
425 aa  308  7e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  40.19 
 
 
420 aa  308  1e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.1 
 
 
404 aa  307  2e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.07 
 
 
441 aa  307  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.48 
 
 
418 aa  306  4e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  39.6 
 
 
414 aa  304  2e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.02 
 
 
414 aa  304  2e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  39.85 
 
 
420 aa  303  4e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  39.56 
 
 
429 aa  303  4e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.32 
 
 
411 aa  303  5e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.56 
 
 
417 aa  301  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.4 
 
 
451 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.31 
 
 
420 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  2.91669e-06 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.01 
 
 
428 aa  299  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.89 
 
 
413 aa  298  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.1 
 
 
412 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.2 
 
 
415 aa  298  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.15 
 
 
404 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.33 
 
 
419 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.56 
 
 
406 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  6.02764e-07 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.69 
 
 
414 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.66 
 
 
408 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.15 
 
 
409 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.03 
 
 
406 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  41.87 
 
 
434 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  38.42 
 
 
423 aa  293  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.83 
 
 
419 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.15 
 
 
414 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  41.15 
 
 
420 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  40.66 
 
 
404 aa  293  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  40.64 
 
 
425 aa  293  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.11 
 
 
413 aa  293  3e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.32 
 
 
406 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  5.7861e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  40.05 
 
 
416 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.86 
 
 
429 aa  293  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.14 
 
 
406 aa  292  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.7 
 
 
414 aa  292  6e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.85 
 
 
449 aa  292  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.45 
 
 
413 aa  292  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.6 
 
 
414 aa  291  9e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  38.86 
 
 
417 aa  291  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.14 
 
 
442 aa  291  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  38.46 
 
 
414 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.83 
 
 
406 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.54851e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.32 
 
 
406 aa  291  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.08 
 
 
406 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  41.32 
 
 
406 aa  291  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>