15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1909 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1909  methanogenesis marker protein 10  100 
 
 
409 aa  833    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1632  hypothetical protein  66.09 
 
 
408 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1781  hypothetical protein  63.88 
 
 
408 aa  534  1e-151  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.415855  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1316  hypothetical protein  58.92 
 
 
407 aa  509  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2512  hypothetical protein  58.23 
 
 
408 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0898  hypothetical protein  50 
 
 
411 aa  425  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2422  hypothetical protein  49.38 
 
 
409 aa  419  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0508  hypothetical protein  48.28 
 
 
413 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0774462  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0867  hypothetical protein  38.93 
 
 
436 aa  323  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1116  methanogenesis marker protein 10  39.28 
 
 
436 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1262  hypothetical protein  39.76 
 
 
455 aa  317  3e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0801  hypothetical protein  38.55 
 
 
436 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0022  hypothetical protein  38.07 
 
 
436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06880  Fe-S oxidoreductase  32 
 
 
455 aa  47  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.364621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0658  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 
336 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>