More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1880 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  100 
 
 
240 aa  497  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  58.8 
 
 
243 aa  306  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  60.94 
 
 
238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  54.89 
 
 
237 aa  275  6e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.67 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.57 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  31.34 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  27.36 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
238 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  29.38 
 
 
253 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  29.82 
 
 
309 aa  81.6  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
216 aa  81.6  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  33.74 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.32 
 
 
229 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 
208 aa  79  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  31.62 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.35 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  40.19 
 
 
312 aa  78.6  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.78 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  42.57 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  31.43 
 
 
236 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  32.19 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  31.43 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.52 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  31.43 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  31.16 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.77 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  38.68 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
278 aa  75.9  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.43 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30.71 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  38.1 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  30.71 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
239 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  33.58 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29.95 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  37.17 
 
 
268 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.99 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.61 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
252 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  36.54 
 
 
267 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  26.37 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3028  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.95 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  30.41 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.09 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  36.54 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.1 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  37.74 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  36.54 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  29.29 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.47 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  28.14 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.27 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  29.29 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  36.19 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  40 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  29.03 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  29.71 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  29.71 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.42 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  39.39 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.64 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  31.08 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25.39 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  29.24 
 
 
331 aa  72  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.99 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  29.71 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  39.81 
 
 
259 aa  72  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  29.82 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  39.39 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
272 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  31.03 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  29.71 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  29.71 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>