131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1855 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1855  CheC, inhibitor of MCP methylation  100 
 
 
204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1335  CheC, inhibitor of MCP methylation  61.19 
 
 
203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.106357  normal  0.431859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0942  CheC, inhibitor of MCP methylation  58.79 
 
 
204 aa  240  9e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31157  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0110  CheA signal transduction histidine kinases  47.52 
 
 
1010 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0112  CheC, inhibitor of MCP methylation  46.73 
 
 
546 aa  185  3e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.559777  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1151  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.9 
 
 
218 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0362  CheC-like protein  40.2 
 
 
200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.749453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1420  CheC, inhibitor of MCP methylation  35.15 
 
 
212 aa  121  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.255557  normal  0.358865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4130  CheC, inhibitor of MCP methylation  39.09 
 
 
198 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000839362  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3200  chemotaxis protein CheC  35.42 
 
 
204 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3210  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.72 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000255077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1666  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.01 
 
 
205 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0231538  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0876  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.99 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2025  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2147  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.47 
 
 
205 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000207835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2028  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 
210 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1416  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.5 
 
 
206 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.28 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0060  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.14 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0802  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.47 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2383  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.41 
 
 
205 aa  96.3  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0720  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.9 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2688  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1402  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.33 
 
 
210 aa  92  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2562  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.17 
 
 
399 aa  91.3  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.348957  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1136  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.85 
 
 
211 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.253061  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0381  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.66 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.66 
 
 
205 aa  89  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07630  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.95 
 
 
207 aa  88.2  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00028074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0714  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.84 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1309  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.34 
 
 
217 aa  87.8  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.632224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2156  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.25 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220055  normal  0.484045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.03 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.03 
 
 
204 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1739  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.08 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2852  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.17 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0462024  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.8 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0132826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3147  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.37 
 
 
422 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0956  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.84 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0635  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.77 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53409e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0621  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.57 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.123197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2020  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.14 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0920  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.21 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.131653  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0236  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.65 
 
 
403 aa  72.8  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3315  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.7 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1888  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.24 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.380829  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3148  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.89 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4604  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.22 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.517072  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.79 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2248  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.27 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.194157  normal  0.143894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0957  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.19 
 
 
201 aa  62  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  27.23 
 
 
321 aa  61.6  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2876  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.12 
 
 
406 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2682  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.57 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.666709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2283  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.23 
 
 
219 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2046  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.24 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00092388 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4460  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.39 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.41 
 
 
422 aa  58.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0257  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.29 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4451  CheC, inhibitor of MCP methylation  30.46 
 
 
206 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2720  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.67 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.84 
 
 
370 aa  57  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  29.29 
 
 
401 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.79 
 
 
357 aa  56.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4470  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.87 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0641616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2380  flagellar motor switch protein  29.71 
 
 
411 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  33.8 
 
 
346 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0769  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.11 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.614105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.8 
 
 
346 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  27.86 
 
 
393 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1736  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.3 
 
 
369 aa  54.3  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4614  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.94 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3527  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.07 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3765  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.29 
 
 
331 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.223383  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0935  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.76 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  31.82 
 
 
372 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2685  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.56 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0739  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.25 
 
 
229 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.91151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0954  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.89 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0927  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.89 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4315  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.55 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3299  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.41 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.450001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0478  flagellar motor switch protein  28.06 
 
 
406 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000894996  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1723  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.4 
 
 
229 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.348388  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0601  putative response regulator  22.91 
 
 
344 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1087  CheC, inhibitor of MCP methylation  31.65 
 
 
333 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0805  flagellar motor switch protein  26.4 
 
 
395 aa  48.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0443911 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0179  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.07 
 
 
229 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1403  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  27.66 
 
 
381 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3710  CheC, inhibitor of MCP methylation  22.6 
 
 
331 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1058  CheC, inhibitor of MCP methylation  25.13 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0684423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2160  flagellar motor switch protein  26.88 
 
 
378 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000995507  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0532  response regulator receiver protein  21.47 
 
 
331 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3793  response regulator receiver protein  21.47 
 
 
331 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3919  response regulator receiver protein  21.47 
 
 
331 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.420864  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  28.4 
 
 
375 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3736  response regulator receiver protein  21.47 
 
 
331 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.279002  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4328  CheC, inhibitor of MCP methylation  24.14 
 
 
331 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0570  response regulator  21.47 
 
 
331 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  25.16 
 
 
554 aa  45.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>