197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1800 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1800  cobalt transport protein  100 
 
 
279 aa  551  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0260  hypothetical protein  36.51 
 
 
266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.79252  normal  0.480643 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2667  cobalt transport protein  26.82 
 
 
266 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0227  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  29.76 
 
 
267 aa  87.8  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0712  cobalt transport protein  28.7 
 
 
243 aa  87  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1879  cobalt transport protein  28.7 
 
 
252 aa  85.5  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.200735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2657  cobalt transport protein  30.23 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287835  hitchhiker  0.000000289223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2498  cobalt transport protein  25.38 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  26.83 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  29.88 
 
 
268 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3887  cobalt transport protein  30.58 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000020913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0625  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.36 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.068602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2681  cobalt ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.02027  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1088  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.79 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.477877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2710  cobalt transport protein  26.14 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2669  cobalt transport protein  25.86 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00761496  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2366  ABC transporter permease protein  26.52 
 
 
268 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0381495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  31.68 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1012  cobalt transport protein  27.24 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000181433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2642  cobalt transport protein  25 
 
 
273 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.357292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1966  cobalt transport protein  25.53 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000103387  decreased coverage  0.000000125707 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  28.95 
 
 
264 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2462  cobalt transport protein  25 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0708  cobalt transport protein  26.91 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0246245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4408  cobalt transport protein  29.92 
 
 
260 aa  75.5  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.371368  normal  0.0141186 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3635  cobalt transport protein  27.61 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0135623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2425  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  24.14 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2659  cobalt transport protein  24.14 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000035997 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0027  hypothetical protein  27.78 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  27.54 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12800  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  27.73 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  27.54 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  26.29 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  28.51 
 
 
269 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0614  cobalt transport protein  24.63 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2247  cobalt transport protein  26.21 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000829673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2288  cobalt transport protein  26.21 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.256211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  27.12 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  27.12 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  27.12 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  27.12 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  27.12 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1801  cobalt transport family protein  24 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3473  cobalt transport protein  31.53 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2485  cobalt transport protein  27.23 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  27.12 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01490  cobalt transport protein  27.91 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000135943  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1501  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  21.2 
 
 
293 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02440  cobalt transport protein  27.91 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000491676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  27.78 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0951  cobalt transport protein  26.32 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.222726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2386  ABC transporter, permease; cobalt transport protein  26.52 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00268022  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1257  cobalt transport protein  28.51 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000290738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0370  cobalt transport protein  29.71 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0226  cobalt transport protein  26.05 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.69 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  26.27 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  26.97 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0337  cobalt transport protein  25.53 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  26.89 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3451  cobalt transport protein  29.01 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  27.12 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1760  cobalt transport protein  25.39 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf374  cobalt ABC transporter, permease protein  22.48 
 
 
314 aa  66.6  0.0000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004205  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0929  cobalt transport protein  25.1 
 
 
271 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000291148  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0682  cobalt transport protein  21.66 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000924748  normal  0.134467 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  26.25 
 
 
265 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0348  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  25.95 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0421011  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1788  cobalt transport protein  25 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.121417  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1545  cobalt transport protein  29.57 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.679113  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0828  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  26.67 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.404494  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2704  cobalt transport protein  23.39 
 
 
285 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  23.9 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  23.95 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0077  cobalt transport protein  23.55 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.67532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2044  cobalt transport protein  30 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.63 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4171  cobalt transport protein  28.74 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00476195  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0227  cobalt transport protein  28.16 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000299101  normal  0.638123 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1554  cobalt ABC transporter permease  23.23 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1045  cobalt transport protein  28.57 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl154  cobalt ABC transporter permease component  30.39 
 
 
332 aa  61.2  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2563  cobalt transport protein  28.31 
 
 
293 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.121483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0997  cobalt transport protein  27.2 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  normal  0.445886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2470  cobalt transport protein  25.21 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105266  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  28.51 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  21.59 
 
 
336 aa  60.5  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1834  putative cobalt ABC transporter, permease protein  23.33 
 
 
273 aa  60.1  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07620  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  28.4 
 
 
276 aa  60.1  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.78 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1950  ABC-type cobalt transport system permease component CbiQ and related transporters-like protein  27.93 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0847  cobalt transport protein  28.22 
 
 
302 aa  59.7  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1034  cobalt transport protein  22.3 
 
 
319 aa  59.3  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.876495  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2707  cobalt transport protein  20.8 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2764  cobalt transport protein  20.8 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001241  transmembrane component MtsC of energizing module of methionine-regulated ECF transporter  24 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.529253  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  23.51 
 
 
770 aa  59.3  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5234  cobalt transport protein  24.05 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  28.63 
 
 
810 aa  58.9  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  25.82 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>