More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1768 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  100 
 
 		 907 aa  1813    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.4 
 
 		 967 aa  228  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0176673  normal  0.174359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  68.46 
 
 		 170 aa  203  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  40.27 
 
 		 779 aa  157  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1544  putative CheW protein  58.39 
 
 		 159 aa  154  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0974613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.08 
 
 		 947 aa  149  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.393804  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2550  CheW protein  44.65 
 
 		 169 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.234406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1769  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  29.69 
 
 		 1343 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.221131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0499  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  28.36 
 
 		 933 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292591  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2032  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  23.94 
 
 		 1285 aa  108  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.295891 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.19 
 
 		 751 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1578  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.21 
 
 		 663 aa  104  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.365209  normal  0.192344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  28.31 
 
 		 765 aa  95.1  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.274696 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  38.31 
 
 		 169 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  35.26 
 
 		 181 aa  92.8  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  35.06 
 
 		 178 aa  92.4  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  35.37 
 
 		 160 aa  91.3  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  40 
 
 		 174 aa  90.1  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2069  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.62 
 
 		 700 aa  89.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  35.93 
 
 		 201 aa  88.2  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.73 
 
 		 162 aa  88.2  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.12 
 
 		 163 aa  87.4  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1098  putative CheW protein  33.53 
 
 		 177 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.428476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  37.16 
 
 		 136 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  30.3 
 
 		 189 aa  84  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  38.71 
 
 		 146 aa  81.6  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  42.16 
 
 		 163 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  36.28 
 
 		 165 aa  81.3  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0967  CheW protein  37.25 
 
 		 178 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  38.02 
 
 		 152 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0003  CheW protein  29.87 
 
 		 200 aa  80.1  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0102214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  38.02 
 
 		 152 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.64 
 
 		 163 aa  79.3  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  33.11 
 
 		 190 aa  79  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.08 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.08 
 
 		 165 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.38 
 
 		 170 aa  78.2  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0875  CheW protein  36.15 
 
 		 154 aa  78.2  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0898  CheW protein  35.1 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.109851  normal  0.161542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.4 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.4 
 
 		 164 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.2 
 
 		 164 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  31.25 
 
 		 164 aa  77  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2885  CheW protein  33.33 
 
 		 404 aa  77.4  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  37.07 
 
 		 179 aa  77  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  31.25 
 
 		 161 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  34.11 
 
 		 189 aa  76.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.44 
 
 		 162 aa  76.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  34.93 
 
 		 154 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0247  CheW protein  30.82 
 
 		 141 aa  75.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.136861  normal  0.143746 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  37.1 
 
 		 146 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.86 
 
 		 161 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.12 
 
 		 620 aa  75.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  30.34 
 
 		 167 aa  75.5  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  35.14 
 
 		 159 aa  75.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.44 
 
 		 174 aa  75.5  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  29.73 
 
 		 176 aa  75.1  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  36.13 
 
 		 184 aa  75.1  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.38 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  30.49 
 
 		 163 aa  74.3  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  28.05 
 
 		 164 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0732  putative CheW protein  36.29 
 
 		 146 aa  74.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189251  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0724  CheW protein  32.69 
 
 		 171 aa  74.3  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1730  CheW protein  36.29 
 
 		 146 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.996579  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  28.05 
 
 		 164 aa  73.9  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  27.08 
 
 		 164 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0792  CheW protein  29.23 
 
 		 164 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  31.39 
 
 		 155 aa  73.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  36.59 
 
 		 139 aa  72.8  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  27.39 
 
 		 163 aa  72.4  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  37.62 
 
 		 167 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  26.45 
 
 		 205 aa  72  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  29.85 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  29.85 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  30.14 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.27 
 
 		 145 aa  71.6  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  34.29 
 
 		 168 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  30.66 
 
 		 568 aa  71.2  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  30.25 
 
 		 183 aa  71.2  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.39 
 
 		 164 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  29.37 
 
 		 154 aa  70.5  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  26.39 
 
 		 161 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  30.83 
 
 		 164 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0143  CheW protein  34.71 
 
 		 162 aa  70.5  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.699834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  27.2 
 
 		 344 aa  70.5  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  27.5 
 
 		 182 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.39 
 
 		 164 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  27.08 
 
 		 163 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.39 
 
 		 164 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.39 
 
 		 164 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.39 
 
 		 164 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2883  CheW protein  31.21 
 
 		 177 aa  70.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.325772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  31.72 
 
 		 173 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  26.39 
 
 		 164 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  30.64 
 
 		 183 aa  69.7  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  25.79 
 
 		 159 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1667  putative CheW protein  33.62 
 
 		 141 aa  69.7  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.33191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  28.23 
 
 		 159 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  30.95 
 
 		 154 aa  70.1  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  28.23 
 
 		 159 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>