116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1756 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 930 aa  1916    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  45.38 
 
 		 581 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  48.54 
 
 		 561 aa  344  5e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  44.25 
 
 		 698 aa  281  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  43.79 
 
 		 697 aa  280  8e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  34.6 
 
 		 1799 aa  270  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  38.81 
 
 		 1262 aa  231  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  36.2 
 
 		 1234 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.06 
 
 		 1085 aa  221  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  39.76 
 
 		 1035 aa  205  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  38.12 
 
 		 954 aa  181  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  50.71 
 
 		 735 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  44.05 
 
 		 627 aa  146  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  44.39 
 
 		 802 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  41.33 
 
 		 919 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  53.9 
 
 		 1732 aa  138  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  55.3 
 
 		 1380 aa  137  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  53.52 
 
 		 3295 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  38.95 
 
 		 522 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  52.11 
 
 		 2554 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.55 
 
 		 1356 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  31.35 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  41.35 
 
 		 823 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  39.51 
 
 		 468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  51.52 
 
 		 845 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  52.55 
 
 		 777 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  53.03 
 
 		 819 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  42.38 
 
 		 966 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.8 
 
 		 719 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  46.48 
 
 		 870 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  38.28 
 
 		 875 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  42.63 
 
 		 749 aa  128  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  31.29 
 
 		 918 aa  127  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.23 
 
 		 1338 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.39 
 
 		 1132 aa  125  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.85 
 
 		 1321 aa  123  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  43.66 
 
 		 840 aa  121  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  45.7 
 
 		 739 aa  120  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  40.28 
 
 		 1387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  47.45 
 
 		 786 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.4 
 
 		 982 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  30.84 
 
 		 1707 aa  111  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  42.33 
 
 		 627 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1024 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  36.42 
 
 		 461 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  36.69 
 
 		 948 aa  101  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  25.61 
 
 		 863 aa  97.1  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.37 
 
 		 630 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.68 
 
 		 933 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.02 
 
 		 569 aa  95.5  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  35.71 
 
 		 801 aa  94.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  34.48 
 
 		 550 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  33.11 
 
 		 798 aa  92.8  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  35.48 
 
 		 1295 aa  89.4  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  34.81 
 
 		 855 aa  89.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  32.45 
 
 		 1004 aa  88.6  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  29.78 
 
 		 1167 aa  85.5  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  30.52 
 
 		 524 aa  84.3  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  31.33 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  25.4 
 
 		 1391 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  26.2 
 
 		 972 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  32.52 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.36 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  26.33 
 
 		 673 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  35.45 
 
 		 705 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  30.19 
 
 		 877 aa  64.7  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  28.22 
 
 		 590 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  28.85 
 
 		 1091 aa  61.6  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  24.4 
 
 		 610 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  31.21 
 
 		 639 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  26.92 
 
 		 853 aa  58.2  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  35.23 
 
 		 869 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  28.38 
 
 		 638 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  33.04 
 
 		 383 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  35.62 
 
 		 600 aa  55.1  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1175  agarase  21.12 
 
 		 598 aa  55.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000232044  unclonable  0.000000011081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2490  2-isopropylmalate synthase  35.56 
 
 		 566 aa  54.7  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  28.35 
 
 		 503 aa  54.7  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  38.57 
 
 		 435 aa  54.7  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  27.21 
 
 		 613 aa  54.3  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  29.48 
 
 		 409 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  33.03 
 
 		 389 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  28.86 
 
 		 1441 aa  53.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  27.78 
 
 		 630 aa  53.5  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  29.53 
 
 		 426 aa  52.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  28.3 
 
 		 684 aa  52.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  33.33 
 
 		 432 aa  51.6  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  28.93 
 
 		 461 aa  51.2  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0242  Band 7 protein  29.61 
 
 		 681 aa  50.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  29.46 
 
 		 604 aa  50.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  28.46 
 
 		 497 aa  50.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  31.88 
 
 		 364 aa  50.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  29.37 
 
 		 1164 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  31.19 
 
 		 536 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  26.55 
 
 		 546 aa  48.9  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3070  hypothetical protein  29.75 
 
 		 233 aa  48.9  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  28.57 
 
 		 1096 aa  48.5  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.48 
 
 		 945 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  26.12 
 
 		 460 aa  48.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  31 
 
 		 535 aa  48.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>