More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1750 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  100 
 
 		 330 aa  674    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  69.82 
 
 		 338 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  64.94 
 
 		 336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  65.02 
 
 		 333 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  58.28 
 
 		 331 aa  414  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  51.4 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  44.75 
 
 		 324 aa  298  8e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  43.87 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  42.5 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  43.83 
 
 		 327 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  43.83 
 
 		 327 aa  285  7e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  43.52 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  44.24 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  38.91 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  36.92 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  35.85 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  36.96 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  36.76 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  36.28 
 
 		 331 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  36.14 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  37.97 
 
 		 341 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  36.11 
 
 		 332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  36.57 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  34.64 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  34.8 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  38.25 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  31.63 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  34.67 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  32.97 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  31.92 
 
 		 481 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 471 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  30.2 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  29.45 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.19 
 
 		 730 aa  75.5  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  27.42 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  28.12 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  22.65 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  25.16 
 
 		 727 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24 
 
 		 716 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  29.74 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  25.95 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  24.53 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.75 
 
 		 736 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  25.21 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  25.9 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  26.27 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  25.95 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  27.73 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.85 
 
 		 599 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  25.98 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0536  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.19 
 
 		 715 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.91 
 
 		 727 aa  63.2  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.17 
 
 		 717 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.97 
 
 		 702 aa  62.8  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  25.33 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  26.56 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  22.71 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  24.68 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1650  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthase II)  24.8 
 
 		 780 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II (FGAM synthase II)  24.8 
 
 		 780 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  28.91 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.88 
 
 		 601 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  22.04 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6116  selenide, water dikinase  28.44 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  26.84 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  32.89 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  23.68 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  28.84 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  29.24 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.73 
 
 		 766 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  26.79 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1693  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25 
 
 		 709 aa  60.1  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.708191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0194  thiamine monophosphate kinase  25.39 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.62059 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.87 
 
 		 737 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  30 
 
 		 331 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  25.45 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.47 
 
 		 779 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1525  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.88 
 
 		 601 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  31.94 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  29.63 
 
 		 359 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  24.91 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0761  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.22 
 
 		 709 aa  59.3  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.36787  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1236  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.71 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.81 
 
 		 779 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0822  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.46 
 
 		 752 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  26.27 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5393  selenide, water dikinase  26.89 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  25.63 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  26.38 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  24.84 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  27.57 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  25.28 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  24.76 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0413  AIR synthase related protein  25.84 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2394  thiamine-monophosphate kinase  27.21 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.38 
 
 		 739 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.87 
 
 		 779 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  27.57 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>