More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1732 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  46.68 
 
 
839 aa  642    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  100 
 
 
873 aa  1775    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  43.06 
 
 
832 aa  591  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  43.37 
 
 
805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  40.9 
 
 
783 aa  561  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  38.55 
 
 
834 aa  490  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  37.31 
 
 
835 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  33.11 
 
 
848 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  32.31 
 
 
847 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  31.79 
 
 
886 aa  383  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  35.16 
 
 
862 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  32.41 
 
 
839 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  30.83 
 
 
783 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  34.24 
 
 
838 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  33.33 
 
 
835 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  30.7 
 
 
783 aa  364  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  32.28 
 
 
810 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  32.73 
 
 
836 aa  357  6.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  31.15 
 
 
872 aa  346  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  31.86 
 
 
783 aa  345  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  31.25 
 
 
837 aa  326  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  32.47 
 
 
835 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  31.75 
 
 
823 aa  303  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  36.41 
 
 
817 aa  303  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  31.74 
 
 
828 aa  301  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0703  peptidase U32  30.47 
 
 
841 aa  298  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  31.43 
 
 
825 aa  297  6e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  32.41 
 
 
877 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  34.14 
 
 
767 aa  294  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  36.78 
 
 
852 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1655  peptidase U32  33.66 
 
 
833 aa  281  4e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296071  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  32.07 
 
 
851 aa  273  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  30.81 
 
 
835 aa  273  1e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  29.46 
 
 
723 aa  270  8.999999999999999e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  31.58 
 
 
840 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  31.49 
 
 
843 aa  261  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1278  peptidase U32  31.59 
 
 
847 aa  261  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.615717 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  29.3 
 
 
878 aa  260  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  36.07 
 
 
792 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  37.03 
 
 
790 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  46.23 
 
 
818 aa  252  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  46.73 
 
 
792 aa  250  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  35.8 
 
 
822 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  46.2 
 
 
790 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  35.62 
 
 
790 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10034  predicted protein  29.28 
 
 
826 aa  244  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  34.19 
 
 
621 aa  241  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  39.57 
 
 
407 aa  239  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  35.51 
 
 
790 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1744  peptidase U32  32.02 
 
 
622 aa  238  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  26.74 
 
 
826 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  39.02 
 
 
406 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  38.63 
 
 
411 aa  234  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0888  peptidase U32  43.59 
 
 
403 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0335605  hitchhiker  0.0000000000241821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1775  peptidase U32  37.57 
 
 
419 aa  230  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.768163  normal  0.436207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  35.67 
 
 
667 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  30.53 
 
 
736 aa  229  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  39.32 
 
 
746 aa  229  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  36.51 
 
 
411 aa  229  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2714  peptidase U32  41.93 
 
 
439 aa  228  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2024  U32 family peptidase  36.24 
 
 
409 aa  228  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  40.06 
 
 
430 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  30.28 
 
 
716 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1526  peptidase U32  42.24 
 
 
412 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31073e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2556  U32 family peptidase  42.95 
 
 
404 aa  227  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1741  U32 family peptidase  35.97 
 
 
409 aa  226  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2261  peptidase U32  37.72 
 
 
404 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105658 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0532  peptidase U32  40.27 
 
 
410 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  40.27 
 
 
696 aa  224  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  32.23 
 
 
653 aa  224  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  32.23 
 
 
667 aa  223  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  32.23 
 
 
653 aa  224  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  32.23 
 
 
667 aa  223  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  32.23 
 
 
667 aa  223  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  32.05 
 
 
653 aa  223  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  33.7 
 
 
654 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  32.05 
 
 
653 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  32.05 
 
 
667 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  33.51 
 
 
668 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  33.78 
 
 
655 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  33.68 
 
 
669 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0991  peptidase U32  39.47 
 
 
427 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  33.7 
 
 
654 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  33.7 
 
 
654 aa  222  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  33.7 
 
 
654 aa  222  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  33.7 
 
 
654 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  29.8 
 
 
722 aa  220  8.999999999999998e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1796  peptidase U32  31.63 
 
 
629 aa  220  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.191326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  34.46 
 
 
654 aa  219  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3705  peptidase U32  34.14 
 
 
638 aa  218  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  32.76 
 
 
640 aa  218  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0753  protease  34.34 
 
 
635 aa  217  5.9999999999999996e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0949  peptidase U32  32.54 
 
 
641 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  39.29 
 
 
420 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3514  peptidase U32  33.46 
 
 
638 aa  217  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.163924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3693  peptidase U32  39.19 
 
 
404 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00154214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3270  peptidase U32  41.16 
 
 
413 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000903684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0957  collagenase-like protease  40.45 
 
 
643 aa  216  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0908875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  36.66 
 
 
406 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0677  U32 family peptidase  31.86 
 
 
639 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>