50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1712 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  699    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  54.3 
 
 		 346 aa  358  5e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  47.92 
 
 		 337 aa  349  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  52.96 
 
 		 338 aa  346  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  51.6 
 
 		 366 aa  338  7e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  43.86 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  44.67 
 
 		 347 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  33.9 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  34.64 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  33.54 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  31.07 
 
 		 347 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  35.41 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  29.34 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  28.49 
 
 		 342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  26.25 
 
 		 352 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  25.47 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  26.04 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  23.53 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  25.97 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  27.76 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  26.85 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  25.18 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.07 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  24.44 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  23.84 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  26.13 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  26.94 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  25.48 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  25.52 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  24.56 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  22.81 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  24.38 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  25.56 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  24.29 
 
 		 333 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  24.11 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.02 
 
 		 340 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.18 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  28.66 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  27.41 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  23.61 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  24.18 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1222  hypothetical protein  30.93 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.997837  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  22.96 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  27.15 
 
 		 350 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  25.35 
 
 		 360 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  24.1 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  24.07 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  26.04 
 
 		 326 aa  43.1  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  27.16 
 
 		 297 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  22.82 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>