91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1704 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1704  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  100 
 
 
262 aa  520  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1295  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  53.26 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0707234  normal  0.0195569 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0529  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  48.08 
 
 
258 aa  227  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1073  hypothetical protein  44.8 
 
 
599 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.842265 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0578  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  43.03 
 
 
254 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.852275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3207  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  41.47 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2148  cobalt transport protein  40.08 
 
 
260 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1218  cobalt ABC transporter, permease protein  40.68 
 
 
260 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1698  cobalt ABC transporter CbiQ, inner membrane subunit  39.54 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000031286  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0144  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.18 
 
 
268 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.183976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2331  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  36.08 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0095  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.83 
 
 
257 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0325  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.06 
 
 
255 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0727  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.19 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197575  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1191  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.48 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1220  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  36.12 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3734  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.14 
 
 
260 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0430563  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0792  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.74 
 
 
254 aa  118  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0187  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  26.84 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0184  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  26.41 
 
 
256 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1859  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.99 
 
 
257 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1062  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.53 
 
 
264 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.104457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1268  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.18 
 
 
259 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2733  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.47 
 
 
241 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.436058  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2603  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.2 
 
 
256 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.25508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0562  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.02 
 
 
256 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.7 
 
 
257 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3658  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.24 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.411896  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1707  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.08 
 
 
225 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1383  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.09 
 
 
299 aa  85.5  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3002  cobalt ABC transporter, permease protein  28.86 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.705016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3890  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  35.19 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3806  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.04 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  33.53 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00358122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0474  cobalt ABC transporter CbiQ, permease subunit  39.78 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1005  cobalt transport protein  25.2 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2618  cobalt transport protein  27.88 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2791  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.98 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295927  decreased coverage  0.000165031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4721  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.49 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4180  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.4 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3822  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.93 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2243  cobalt ABC transporter permease CbiQ  25.14 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.142646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1150  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.76 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2143  cobalt ABC transporter, permease protein CbiQ  25.14 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2190  cobalt ABC transporter permease CbiQ  25.14 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.757374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2197  cobalt ABC transporter permease protein CbiQ  25.14 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2356  cobalt ABC transporter permease CbiQ  24.58 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.208194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1757  cobalt transport protein  28.57 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3591  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.05 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2593  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.64 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.08926  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1547  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000302201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0541  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.59 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.906883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1695  cobalt transport protein  35.05 
 
 
246 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2471  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.17 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1571  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  26.72 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.18 
 
 
244 aa  55.5  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0576637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1008  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  30.43 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0328725  normal  0.157813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0485  cobalt transport protein  23.53 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1353  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.07 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2781  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115944  decreased coverage  0.00193081 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1118  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.43 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.933016 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1183  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  29.6 
 
 
265 aa  49.3  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.239886  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1046  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.58 
 
 
271 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0714  cobalt transport protein  26.67 
 
 
226 aa  49.3  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2822  cobalt transport protein  28.98 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.234298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2293  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.15 
 
 
259 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2186  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.88 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00517893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4017  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  32.99 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0274  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  28.48 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1329  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.57 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2136  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  31.19 
 
 
260 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4056  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  25.13 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0162  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  27.04 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.227232  normal  0.133608 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0899  cobalt transport protein  29.87 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120093  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0629  cobalt transport protein  34.59 
 
 
438 aa  46.6  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.35082  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0745  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.44 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0134  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.62 
 
 
255 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.298184  normal  0.0440058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0774  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  34.44 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0589694  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5177  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.49 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2427  cobalt transport protein  27.91 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0236294  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0170  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  22.46 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0514  cobalt ABC transporter inner membrane subunit CbiQ  25.71 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113619  normal  0.150411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2020  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.53 
 
 
252 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2006  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  23.23 
 
 
251 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0118677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1929  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.55 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0666  cobalt ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
336 aa  42.7  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  29.41 
 
 
264 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2224  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  24.68 
 
 
270 aa  42.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000240215  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3138  cobalt ABC transporter, inner membrane subunit CbiQ  26.09 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  27.27 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1477  cobalt transport protein  25.83 
 
 
288 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>