52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1671 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1671  DsrE family protein  100 
 
 
120 aa  244  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620887  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2096  DsrE family protein  39.17 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1550  DsrE family protein  38.14 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0963  DsrE family protein  36.59 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.153749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2209  hypothetical protein  36.13 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0161912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  30.25 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  31.73 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  33.61 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1774  DsrE family protein  30.48 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1037  DsrE family protein  30.48 
 
 
271 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  29.17 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0907  DsrE family protein  28.57 
 
 
271 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.386859  normal  0.458991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  25.64 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1074  DsrE family protein  31.25 
 
 
133 aa  57.8  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000610155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  27.71 
 
 
169 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2548  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2176  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000345804 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  28.31 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1753  hypothetical protein  34.15 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0533  hypothetical protein  31.2 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140333  unclonable  0.0000000000215386 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0363  hypothetical protein  31.2 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63360  hypothetical protein  29.17 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926031  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  26.51 
 
 
169 aa  50.1  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  26.51 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2643  DsrE family protein  21.8 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0166482  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0986  hypothetical protein  25.98 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163043  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5517  hypothetical protein  29.17 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  24.84 
 
 
170 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.57 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  23.6 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  25.9 
 
 
169 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  22.98 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  27.83 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1244  hypothetical protein  31.71 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  23.57 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  25.22 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1141  hypothetical protein  27.91 
 
 
125 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1226  DsrE family protein  24.17 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.306048  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  23.65 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1443  DsrE family protein  24.17 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3384  hypothetical protein  26.35 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0433  DsrE-like protein  26.67 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.911258 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1286  hypothetical protein  34.15 
 
 
124 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2495  hypothetical protein  24.55 
 
 
175 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0575  hypothetical protein  23.53 
 
 
169 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000240912  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2876  hypothetical protein  24.55 
 
 
207 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00403989  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 
817 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1311  DsrE family protein  28.83 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0996  hypothetical protein  25.58 
 
 
151 aa  41.2  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.377605  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.36 
 
 
938 aa  41.2  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  25.17 
 
 
163 aa  40.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  25.36 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>