129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1629 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1629  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  100 
 
 
175 aa  343  1e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.301211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0624  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  56.73 
 
 
175 aa  192  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2310  YeeE/YedE family protein  49.7 
 
 
173 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.996502  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0801  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  47.06 
 
 
171 aa  164  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.897087  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2856  hypothetical protein  41.98 
 
 
175 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1597  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  43.12 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1168  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.41 
 
 
172 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.709858  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1978  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  39.38 
 
 
174 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.248725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2969  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  39.75 
 
 
172 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0175  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.51 
 
 
176 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3682  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  41.98 
 
 
180 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137172  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1868  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.35 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1695  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  36.05 
 
 
181 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000630724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3015  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.35 
 
 
133 aa  99  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4308  hypothetical protein  36.42 
 
 
174 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0054  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.53 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0689897  normal  0.802997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0053  hypothetical protein  35.53 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101016  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1366  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.89 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1463  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.93 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0788  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  34.97 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0768937  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11778  hypothetical protein  32.43 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0171  YeeE/YedE  32.94 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.96637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3344  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  35.04 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0556  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.9 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000027249  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1156  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  29.49 
 
 
407 aa  63.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.643231  normal  0.0925546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00550  predicted transporter component  41.24 
 
 
385 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2608  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.46 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4882  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.12 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437819  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2596  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.94 
 
 
171 aa  61.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0269  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.02 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22780  YeeE/YedE family protein (DUF395)  30.59 
 
 
375 aa  59.7  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1835  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.52 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2101  inner membrane protein YeeE  28.93 
 
 
344 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2678  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.782906  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1172  hypothetical protein  31.45 
 
 
373 aa  58.5  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1028  hypothetical protein  31.61 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.637792  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3331  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30 
 
 
186 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286233  hitchhiker  0.0021122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3116  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.18 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0104  hypothetical protein  27.81 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.313018 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6934  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.2 
 
 
191 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.16 
 
 
187 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207373  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4108  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  30.59 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.629553  normal  0.177629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2804  hypothetical protein  27.54 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04720  YeeE/YedE family protein (DUF395)  31.16 
 
 
359 aa  52.4  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1214  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  37.04 
 
 
100 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0826897  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0682  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.12 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0358  YeeE/YedE family protein  45.61 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0512  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.03 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1899  YeeE/YedE family protein  45.61 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279304  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1813  YeeE/YedE family protein  45.61 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0511  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  41.3 
 
 
330 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2080  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  27.44 
 
 
412 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0438  hypothetical protein  35.51 
 
 
144 aa  48.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.616071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0258  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.24 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1966  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  36.36 
 
 
421 aa  47.8  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3295  YeeE/YedE family protein  34.52 
 
 
159 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.544227 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0938  YeeE/YedE family protein  43.86 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1086  YeeE/YedE family protein  45.61 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0490771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2107  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.15 
 
 
159 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0444  YeeE/YedE family protein  43.86 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0203  YeeE/YedE family protein  43.86 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1478  putative inner membrane protein  28.57 
 
 
414 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1403  YeeE/YedE family protein  43.86 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.14374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2448  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35 
 
 
251 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2423  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.37 
 
 
174 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2818  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  26.67 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0425714  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3681  putative membrane protein of unknown function with YeeE/YedE motives  32.71 
 
 
366 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241689  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3143  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  38.46 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.151117  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2716  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.21 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.653376  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3703  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.49 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.224672  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1823  transporter component  36.14 
 
 
343 aa  45.1  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00974172  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0812  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.94 
 
 
462 aa  45.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2811  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  30.64 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6793  hypothetical protein  32.99 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0320556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4545  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  28.4 
 
 
407 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891031  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12633  hypothetical protein  48.94 
 
 
185 aa  44.7  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.318164  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0329  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.03 
 
 
144 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0449  hypothetical protein  31.45 
 
 
394 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4161  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  28.26 
 
 
360 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0334  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  38.6 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0855  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  35.29 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000829035 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000102  DUF395 domain-containing protein  34.44 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268388  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2075  hypothetical protein  27.04 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.718752  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1997  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  26.42 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765008  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6241  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  34.04 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.837043  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0314  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.03 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2497  integral membrane protein  30.2 
 
 
139 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2946  membrane protein, YeeE/YedE family  25.9 
 
 
352 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000897604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0799  YeeE/YedE  29.63 
 
 
373 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236196  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2696  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  27.06 
 
 
360 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3632  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2350  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  31.91 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3826  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  29.56 
 
 
405 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000399635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4152  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  33.7 
 
 
347 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0839918  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01950  YeeE/YedE family protein  40.74 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01916  predicted inner membrane protein  25.18 
 
 
352 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4319  protein of unknown function DUF395, YeeE/YedE  25.67 
 
 
354 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0355318  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4076  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  53.06 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0200066  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1027  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  32.38 
 
 
145 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.77187  normal  0.911099 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1170  protein of unknown function DUF395 YeeE/YedE  24.53 
 
 
368 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.100634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>