More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1617 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1617  transcriptional regulator, HxlR family  100 
 
 
117 aa  242  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.19292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0946  HxlR family transcriptional regulator  82.05 
 
 
117 aa  198  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal  0.613112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1541  putative transcriptional regulator  54.37 
 
 
121 aa  124  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000091847  normal  0.207791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0703  transcriptional regulator, HxlR family  60.2 
 
 
134 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.383651  normal  0.144185 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0013  HxlR family transcriptional regulator  47.71 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2974  transcriptional regulator, HxlR family  54.64 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.607542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3442  transcriptional regulator, HxlR family  55.34 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000021737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1352  putative transcriptional regulator  55.24 
 
 
155 aa  117  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000297864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1564  HxlR family transcriptional regulator  57.89 
 
 
119 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0663317  normal  0.0831873 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3110  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1834  hypothetical protein  56.12 
 
 
114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.118626  normal  0.386956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3435  hypothetical protein  57.14 
 
 
114 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3203  hypothetical protein  56.12 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.135519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3457  hypothetical protein  56.12 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3332  hypothetical protein  51.92 
 
 
126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3133  hypothetical protein  50.94 
 
 
126 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.441436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3120  transcriptional regulator  50.94 
 
 
126 aa  114  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3027  transcriptional regulator  50.94 
 
 
126 aa  114  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.710275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1377  MarR family transcriptional regulator  50.5 
 
 
122 aa  114  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3379  hypothetical protein  50.94 
 
 
126 aa  114  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3354  hypothetical protein  50.94 
 
 
126 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3357  hypothetical protein  50.94 
 
 
129 aa  114  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1899  hypothetical protein  50.94 
 
 
126 aa  114  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4102  transcriptional regulator, HxlR family  50.49 
 
 
118 aa  114  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3638  transcriptional regulator, HxlR family  55.91 
 
 
129 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3895  HxlR family transcriptional regulator  55.67 
 
 
120 aa  114  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000755308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5212  hypothetical protein  57.58 
 
 
114 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01970  transcriptional regulator  50.93 
 
 
140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1262  transcriptional regulator, HxlR family  53.27 
 
 
148 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3059  HxlR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
124 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5208  hypothetical protein  54.9 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4895  HxlR family transcriptional regulator  56.57 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3418  putative transcriptional regulator  52.38 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0808  HxlR family transcriptional regulator  52.94 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.40472  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1088  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0952  HxlR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.473433  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0036  hypothetical protein  54.9 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000638982 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0015  transcriptional regulator, HxlR family  53.19 
 
 
107 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2255  transcriptional regulator, HxlR family  54.08 
 
 
159 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.395748  normal  0.27377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5039  putative transcriptional regulatory protein  54.26 
 
 
125 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4933  hypothetical protein  53.92 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4774  transciprtional regulator  53.92 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4794  transciprtional regulator  53.92 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5311  hypothetical protein  53.92 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5176  hypothetical protein  53.92 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0230101 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5225  hypothetical protein  53.92 
 
 
114 aa  110  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0178  hypothetical protein  51.49 
 
 
114 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0386  HxlR family transcriptional regulator  52.48 
 
 
159 aa  110  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26449  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3157  helix-turn-helix, HxlR type  55.91 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2245  transcriptional regulator, HxlR family  49.59 
 
 
128 aa  110  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3440  hypothetical protein  53.47 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3209  hypothetical protein  53.47 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3115  MarR family transcriptional regulator  53.47 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.451528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3462  hypothetical protein  53.47 
 
 
113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1819  hypothetical protein  53.76 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.100816 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1063  transcriptional regulator  50 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0576989  hitchhiker  0.000107529 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1109  HxlR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116925  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3187  MarR family transcriptional regulator  52.48 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3428  hypothetical protein  52.48 
 
 
114 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2802  transcriptional regulator, HxlR family  48.18 
 
 
127 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3119  HxlR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
107 aa  107  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0144533  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0379  transcriptional regulator  51.02 
 
 
115 aa  107  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0341948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0252  transcriptional regulator, HxlR family  48.94 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3428  hypothetical protein  53.12 
 
 
107 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.157748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0862  transcriptional regulator, HxlR family  50.49 
 
 
119 aa  106  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0948  transcriptional regulator, HxlR family  45.83 
 
 
151 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4746  HxlR family transcriptional regulator  50.51 
 
 
116 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1097  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
134 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199182  normal  0.222478 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2547  transcriptional regulator, MarR family  47.71 
 
 
112 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2498  transcriptional regulator, HxlR family  46.79 
 
 
114 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.288645  normal  0.230833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3223  hypothetical protein  52.69 
 
 
107 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3200  MarR family transcriptional regulator  52.69 
 
 
107 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0287258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3455  hypothetical protein  51.04 
 
 
107 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.365377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3441  hypothetical protein  52.69 
 
 
107 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5072  transcriptional regulator, HxlR family  47.06 
 
 
117 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3129  MarR family transcriptional regulator  51.04 
 
 
115 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.576671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3438  hypothetical protein  51.61 
 
 
107 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5989  transcriptional regulator, HxlR family  52.69 
 
 
133 aa  103  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1317  HxlR family transcriptional regulator  49.52 
 
 
122 aa  103  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000449926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1489  transcriptional regulator, HxlR family  50.54 
 
 
130 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2387  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 
115 aa  103  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157796  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1684  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 
119 aa  103  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2778  transcriptional regulator  46.79 
 
 
112 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000060346 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1702  transcriptional regulator, HxlR family  46.81 
 
 
115 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.371682  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0456  transcriptional regulator, HxlR family  47.32 
 
 
149 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.208849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3427  hypothetical protein  50.53 
 
 
108 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2474  transcriptional regulator, HxlR family  48.42 
 
 
115 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1081  HxlR family transcriptional regulator  50.54 
 
 
125 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124143  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2737  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 
121 aa  101  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0290  transcriptional regulator protein-like protein  44.64 
 
 
154 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0802  transcriptional regulator, HxlR family  43.69 
 
 
106 aa  100  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0464121  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1480  transcriptional regulator, HxlR family  47.57 
 
 
152 aa  100  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3439  hypothetical protein  50.53 
 
 
108 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0373  putative transcriptional regulator  47.92 
 
 
123 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0376009  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2005  transcriptional regulator family protein  50.53 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1607  transcriptional regulator, HxlR family  51.58 
 
 
113 aa  99.8  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000104346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0933  transcriptional regulator, HxlR family  50 
 
 
108 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.973186 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2738  transcriptional regulator family protein  50.53 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.115101  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3126  putative transcriptional regulator  50.53 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1870  transcriptional regulator family protein  50.53 
 
 
144 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>