More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1512 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  59.09 
 
 
885 aa  1096    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  60.47 
 
 
880 aa  1121    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  100 
 
 
896 aa  1849    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  60.24 
 
 
878 aa  1110    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  54.31 
 
 
879 aa  994    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  58.51 
 
 
394 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  57.65 
 
 
394 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  57.77 
 
 
393 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  54.36 
 
 
393 aa  424  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  44.11 
 
 
408 aa  335  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.71 
 
 
415 aa  333  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.72 
 
 
409 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  46.89 
 
 
393 aa  332  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.72 
 
 
406 aa  330  9e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  46.65 
 
 
392 aa  326  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.53 
 
 
406 aa  325  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.58 
 
 
414 aa  324  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.48 
 
 
414 aa  324  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.28 
 
 
412 aa  322  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.25 
 
 
412 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  42.75 
 
 
421 aa  320  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.5 
 
 
425 aa  318  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  42.82 
 
 
406 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  42.82 
 
 
406 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  42.82 
 
 
406 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  42.82 
 
 
406 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.61 
 
 
410 aa  313  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.56 
 
 
414 aa  313  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  42.57 
 
 
406 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.82 
 
 
406 aa  312  2e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.57 
 
 
406 aa  312  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
406 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
406 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  42.82 
 
 
406 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  46.74 
 
 
408 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.56 
 
 
414 aa  311  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.2 
 
 
417 aa  311  4e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.25 
 
 
419 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.54 
 
 
412 aa  309  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  41.81 
 
 
413 aa  309  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  42.82 
 
 
406 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.32 
 
 
418 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  43 
 
 
441 aa  308  4.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  37.74 
 
 
667 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  41.75 
 
 
420 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.72 
 
 
414 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.9 
 
 
414 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.4 
 
 
413 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.4 
 
 
413 aa  302  1e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.19 
 
 
420 aa  302  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.93 
 
 
435 aa  302  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.3 
 
 
412 aa  302  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  43.01 
 
 
410 aa  301  3e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  41.77 
 
 
429 aa  301  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  41.5 
 
 
420 aa  301  4e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  41.54 
 
 
423 aa  301  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  43.11 
 
 
414 aa  300  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2122  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.76 
 
 
435 aa  300  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0104519  normal  0.0677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.13 
 
 
433 aa  300  8e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  40.61 
 
 
410 aa  299  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.63 
 
 
421 aa  299  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12890  cysteine desulfurase  40.43 
 
 
422 aa  299  1e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.67 
 
 
434 aa  299  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.55 
 
 
404 aa  299  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  41.39 
 
 
429 aa  299  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  43.18 
 
 
434 aa  298  4e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.05 
 
 
411 aa  296  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.76 
 
 
443 aa  296  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16680  cysteine desulfurase  42.57 
 
 
425 aa  295  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.815163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  42.63 
 
 
405 aa  294  6e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.65 
 
 
415 aa  293  9e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.57 
 
 
417 aa  292  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.12 
 
 
404 aa  292  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  39.04 
 
 
414 aa  292  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.19 
 
 
420 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.44 
 
 
434 aa  290  9e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.23 
 
 
428 aa  290  9e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  40.4 
 
 
395 aa  290  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.2 
 
 
442 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.11 
 
 
429 aa  290  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  41.6 
 
 
417 aa  289  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.81 
 
 
451 aa  288  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.86 
 
 
429 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1433  cysteine desulphurases, SufS  38.42 
 
 
416 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.37 
 
 
429 aa  288  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.75 
 
 
435 aa  288  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.2 
 
 
429 aa  287  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.64 
 
 
407 aa  287  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  41.09 
 
 
404 aa  287  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00781  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  38.6 
 
 
419 aa  287  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.674845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0567  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.28 
 
 
416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.93631  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  37.19 
 
 
408 aa  285  2.0000000000000002e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01341  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  38.17 
 
 
416 aa  286  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.284649  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.75 
 
 
415 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.25 
 
 
419 aa  285  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39 
 
 
419 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.39 
 
 
407 aa  283  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.75 
 
 
413 aa  283  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.53 
 
 
414 aa  283  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.49 
 
 
413 aa  282  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>