92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1500 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1500  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2041  hypothetical protein  86.25 
 
 		 350 aa  424  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0891  hypothetical protein  58.58 
 
 		 359 aa  281  6.000000000000001e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000006304  unclonable  0.000000000000289019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4168  hypothetical protein  58.4 
 
 		 366 aa  276  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4371  hypothetical protein  54.11 
 
 		 343 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.634323 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1215  hypothetical protein  53.62 
 
 		 344 aa  261  1e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0598  hypothetical protein  54.51 
 
 		 333 aa  257  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1889  hypothetical protein  56.02 
 
 		 369 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1093  hypothetical protein  54.01 
 
 		 342 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1180  virulence protein-like protein  55.13 
 
 		 354 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3119  putative DNA-binding protein  55.46 
 
 		 342 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2655  hypothetical protein  56.6 
 
 		 352 aa  252  3e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1487  hypothetical protein  52.38 
 
 		 358 aa  249  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.011312  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  51.08 
 
 		 340 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1490  hypothetical protein  50.65 
 
 		 344 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.507722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0687  putative DNA-binding protein  48.94 
 
 		 342 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3988  putative cytoplasmic protein  49.57 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0596  hypothetical protein  45.99 
 
 		 342 aa  228  6e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0348  hypothetical protein  46.75 
 
 		 342 aa  227  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000520981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4009  hypothetical protein  47.84 
 
 		 340 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0294  hypothetical protein  48.94 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0966  hypothetical protein  47.41 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  0.835513 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0828  hypothetical protein  47.41 
 
 		 355 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0259  hypothetical protein  46.55 
 
 		 334 aa  223  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1091  virulence protein-like protein  47.21 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0746  hypothetical protein  49.15 
 
 		 350 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.126739 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1214  hypothetical protein  48.26 
 
 		 342 aa  221  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4145  virulence protein  49.15 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.373189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4082  virulence protein  49.15 
 
 		 345 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3012  hypothetical protein  48.93 
 
 		 331 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2605  virulence protein  53.04 
 
 		 365 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4765  hypothetical protein  47.44 
 
 		 344 aa  215  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  42.68 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  45.26 
 
 		 352 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0032  putative cytoplasmic protein  47.01 
 
 		 341 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2487  hypothetical protein  46.12 
 
 		 345 aa  210  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4076  hypothetical protein  45.73 
 
 		 341 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1866  putative DNA-binding protein  48.51 
 
 		 335 aa  209  3e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0998  hypothetical protein  44.16 
 
 		 356 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000328283 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0131  DNA-binding protein  47.01 
 
 		 335 aa  204  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4094  hypothetical protein  45.45 
 
 		 256 aa  204  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0243  hypothetical protein  46.29 
 
 		 353 aa  203  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  46.35 
 
 		 334 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0007  putative DNA-binding protein  47.6 
 
 		 336 aa  203  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  43.53 
 
 		 352 aa  202  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3353  virulence protein  44.78 
 
 		 336 aa  202  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0319779  normal  0.0105196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2347  putative DNA-binding protein  46.29 
 
 		 338 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169677  normal  0.0120651 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0367  hypothetical protein  46.09 
 
 		 339 aa  202  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  42.37 
 
 		 351 aa  201  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  41.83 
 
 		 353 aa  201  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0969  hypothetical protein  46.35 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3721  putative DNA-binding protein  46.96 
 
 		 352 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.299367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  42.24 
 
 		 353 aa  195  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2422  hypothetical protein  45.26 
 
 		 334 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4641  hypothetical protein  47.16 
 
 		 333 aa  190  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  40.57 
 
 		 357 aa  180  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3664  putative DNA-binding protein  43.48 
 
 		 343 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.676016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1567  putative DNA-binding protein  39.11 
 
 		 356 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0208212  unclonable  0.0000160594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2815  hypothetical protein  29.22 
 
 		 344 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.213356  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1798  hypothetical protein  48.39 
 
 		 197 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3598  death-on-curing family protein  34.45 
 
 		 328 aa  121  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1087  DNA-binding protein  43.8 
 
 		 141 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.251597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1373  death-on-curing protein  39.71 
 
 		 336 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0513  putative DNA-binding protein  36.69 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.63298  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1469  death-on-curing protein  35.96 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.285933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2570  hypothetical protein  42.74 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1805  death-on-curing protein  41.46 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1273  hypothetical protein  44.74 
 
 		 126 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0685  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 324 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0834  death-on-curing family protein  37.5 
 
 		 324 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.674738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0644  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  98.2  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.628012  normal  0.733979 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2013  death-on-curing protein  37.67 
 
 		 330 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2544  hypothetical protein  44.83 
 
 		 127 aa  96.3  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.712716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0996  death-on-curing family protein  28.36 
 
 		 326 aa  96.3  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1123  death-on-curing protein  42.48 
 
 		 333 aa  95.5  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1126  RhuM  28 
 
 		 328 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1636  death-on-curing family protein  36.44 
 
 		 334 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0280  death-on-curing protein  36.97 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000133606 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0360  death-on-curing family protein  32.89 
 
 		 198 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0879  death-on-curing family protein  31.62 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0194  hypothetical protein  31.25 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1420  prophage maintenance system killer protein (DOC)  34.15 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0381  death-on-curing family protein  31.82 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0780  Virulence protein-like protein  51.39 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0656  putative virulence protein  30.51 
 
 		 135 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0339  putative cytoplasmic protein  42.65 
 
 		 105 aa  67.4  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2318  Virulence protein-like protein  35.05 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1011  hypothetical protein  39.73 
 
 		 81 aa  57  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1807  HTH-type DNA-binding domain/DOC/FIC domain-containing protein  38.36 
 
 		 81 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1749  DNA-binding protein  29.17 
 
 		 90 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1599  hypothetical protein  56.76 
 
 		 154 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.033963  hitchhiker  0.000543147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0821  DNA-binding protein  37.84 
 
 		 164 aa  49.3  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.496709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>