More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1472 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1472  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000374742  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1677  transcriptional regulator, XRE family  84.62 
 
 
72 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  80.65 
 
 
69 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3036  XRE family transcriptional regulator  69.35 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  70.31 
 
 
69 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1630  XRE family transcriptional regulator  67.74 
 
 
63 aa  94  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  68.75 
 
 
74 aa  94  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1410  XRE family transcriptional regulator  60.94 
 
 
72 aa  84.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  54.84 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 
69 aa  81.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0292  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 
63 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1517  XRE family transcriptional regulator  58.06 
 
 
73 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3339  transcriptional regulator  54.69 
 
 
68 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00325115  hitchhiker  0.00415733 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  53.23 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 
70 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4745  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 
77 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0813  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.284678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1719  XRE family transcriptional regulator  53.85 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  48.48 
 
 
68 aa  72  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  56.67 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0138  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0315145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1159  DNA-binding protein  58.33 
 
 
67 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0320  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 
66 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0834258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0235  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
66 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1664  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 
66 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.609845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3714  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0019  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  51.56 
 
 
65 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1123  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.503479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1932  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000103733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
71 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  50 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  47.69 
 
 
65 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5666  DNA-binding protein  50 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  47.69 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1211  XRE family transcriptional regulator  51.56 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  50 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5169  DNA-binding protein  46.88 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0075  DNA-binding protein  45.59 
 
 
73 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4855  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 
73 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3410  transcriptional regulator, XRE family protein  55 
 
 
64 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5175  DNA-binding protein  45.59 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5184  DNA-binding protein  45.59 
 
 
73 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  54.24 
 
 
72 aa  68.2  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2424  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.21455  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  49.23 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3627  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1666  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 
64 aa  67.4  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5404  DNA-binding protein  48.33 
 
 
70 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5139  DNA-binding protein  45.59 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5278  DNA-binding protein  48.33 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5336  DNA-binding protein  48.33 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5261  DNA-binding protein  48.33 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4895  DNA-binding protein  45.59 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5023  DNA-binding protein  48.33 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  48.39 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4739  DNA-binding protein  45.59 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4853  DNA-binding protein; transcriptional regulator  48.33 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4758  DNA-binding protein  45.59 
 
 
73 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0571449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4868  DNA-binding protein; transcriptional regulator  48.33 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5270  DNA-binding protein  46.88 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0689  XRE family transcriptional regulator  54.1 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285509  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5291  DNA-binding protein  48.33 
 
 
65 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  43.48 
 
 
69 aa  67  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0246  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4519  DNA-binding protein  41.67 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4366  transcriptional regulator  41.67 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0270567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4871  DNA-binding protein  41.67 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2552  transcriptional regulator  49.23 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.954813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1885  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000259455 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4967  XRE family transcriptional regulator  48.33 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0512  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 
72 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.994286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 
73 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0207  XRE family transcriptional regulator  53.33 
 
 
63 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  52.73 
 
 
65 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3240  transcriptional regulator, XRE family  48.33 
 
 
66 aa  64.7  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0543  transcriptional regulator, XRE family  48.39 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  46.77 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  51.67 
 
 
62 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3871  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0238675  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  48.44 
 
 
64 aa  63.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3360  DNA-binding protein  44.44 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.534769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  46.77 
 
 
67 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1613  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
71 aa  63.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0277  XRE family transcriptional regulator  43.08 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.189848  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 
224 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0060  DNA-binding protein  45 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  45.16 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0346696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>