More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1459 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 249 aa  473  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  82.73 
 
 		 249 aa  384  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  75.5 
 
 		 249 aa  383  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  78.31 
 
 		 249 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  72.36 
 
 		 249 aa  363  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  70.28 
 
 		 249 aa  350  1e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  49.19 
 
 		 250 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  45.53 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  48.11 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  39.76 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.36 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  45.58 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  39.17 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  45.28 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  39.27 
 
 		 251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1239  hypothetical protein  76.27 
 
 		 126 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0798004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  41.63 
 
 		 270 aa  168  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  37.25 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.47 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  36.03 
 
 		 253 aa  161  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  35.69 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  40.38 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  37.61 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 		 288 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.1 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  38.1 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  41.75 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  38 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 270 aa  141  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  38.68 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  30.36 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  38.33 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 278 aa  123  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  34.7 
 
 		 255 aa  120  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1789  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 285 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  33.87 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  32.07 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 260 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  33.02 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0945  ABC transporter related  32.37 
 
 		 665 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  29.37 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  29.31 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  33.75 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 290 aa  96.3  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 292 aa  95.5  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  28.23 
 
 		 286 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1861  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  28.08 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  28.77 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0899  ABC transporter, inner membrane subunit  31.75 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.208954  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  26.85 
 
 		 270 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 297 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  27.13 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1894  putative daunorubicin resistance ABC transporter, permease protein  29.95 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3881  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.574088  normal  0.697417 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  27.02 
 
 		 369 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0948  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 287 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0389515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0950  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  29.49 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.65 
 
 		 257 aa  89.4  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  30.89 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  26.85 
 
 		 241 aa  88.6  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5008  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.113041 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  31.07 
 
 		 366 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 286 aa  87  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  28.63 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  24.91 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5312  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.91396  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 256 aa  86.7  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0243  hypothetical protein  31.33 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.113541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  27.08 
 
 		 263 aa  85.5  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0103  ABC-2 type transporter  31.17 
 
 		 262 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.759758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  28.28 
 
 		 256 aa  85.5  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2845  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 269 aa  85.5  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2716  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 297 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722099  normal  0.404026 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1221  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.389129  decreased coverage  0.00710452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>