More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1434 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1434  sulphate transporter  100 
 
 
567 aa  1126    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2518  sulfate transporter  53.23 
 
 
566 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.440075  normal  0.566321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6352  sulphate transporter  50 
 
 
575 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.734551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2521  sulphate transporter  47.85 
 
 
570 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.062267 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5881  sulphate transporter  45.45 
 
 
570 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4477  sulphate transporter  44.95 
 
 
624 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.496082 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2077  sulfate transporter  45.9 
 
 
565 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1268  sulphate transporter  46.58 
 
 
658 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0855544  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5729  sulphate transporter  45.05 
 
 
572 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.46333 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3792  sulphate transporter  44.77 
 
 
619 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4576  sulphate transporter  45.05 
 
 
572 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2980  sulphate transporter  43.22 
 
 
558 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0095  sulphate transporter  39.03 
 
 
550 aa  329  7e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.618009  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  33.09 
 
 
574 aa  286  7e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  32.53 
 
 
560 aa  277  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  33.52 
 
 
592 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  32.06 
 
 
575 aa  263  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  32.59 
 
 
590 aa  257  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  32.96 
 
 
565 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  31.89 
 
 
576 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  30.84 
 
 
579 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  30.84 
 
 
579 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  30.88 
 
 
578 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2484  sulphate transporter  31.3 
 
 
585 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.147212  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1978  sulphate transporter  31.3 
 
 
585 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00518519  hitchhiker  0.000000194119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2381  sulphate transporter  31.3 
 
 
585 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2369  sulphate transporter  31.3 
 
 
585 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00714567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  29.77 
 
 
567 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  30.31 
 
 
563 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  31.81 
 
 
576 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1755  sulphate transporter  31.11 
 
 
585 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42576  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  31.08 
 
 
568 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2264  sulphate transporter  30.93 
 
 
585 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158734  normal  0.496972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  31.08 
 
 
568 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1835  sulphate transporter  31.55 
 
 
585 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790063  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  31.26 
 
 
568 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  30.23 
 
 
596 aa  237  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2286  sulfate permease family protein  30.74 
 
 
585 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  30.47 
 
 
579 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2132  sulphate transporter  31.35 
 
 
590 aa  233  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002776  putative sulfate permease  29.9 
 
 
591 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.408256  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1630  sulphate transporter  30.97 
 
 
600 aa  233  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  30.29 
 
 
573 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  28.79 
 
 
583 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  26.93 
 
 
569 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  30.86 
 
 
575 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  26.93 
 
 
569 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  29.39 
 
 
573 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  28.52 
 
 
580 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  32.39 
 
 
591 aa  223  7e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6130  sulfate transporter  30.14 
 
 
563 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0582115 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  29.25 
 
 
590 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  29.48 
 
 
570 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  30.19 
 
 
592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  29.98 
 
 
586 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  29.37 
 
 
582 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  29.15 
 
 
570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1878  sulphate transporter  28.8 
 
 
572 aa  217  5e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.536686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  29.06 
 
 
570 aa  216  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  32.34 
 
 
588 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  28.15 
 
 
588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2042  sulphate transporter  28.8 
 
 
578 aa  213  7e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.875705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0705  sulphate transporter  28.8 
 
 
570 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.471321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  30.39 
 
 
569 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  30.99 
 
 
566 aa  210  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22210  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  29.48 
 
 
601 aa  210  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2603  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.06 
 
 
574 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  30.45 
 
 
558 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  28.05 
 
 
584 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.8 
 
 
571 aa  207  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  29.55 
 
 
550 aa  205  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  28.01 
 
 
578 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  26.7 
 
 
608 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  30.24 
 
 
595 aa  205  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  30.31 
 
 
585 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  29.01 
 
 
572 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  29.38 
 
 
557 aa  204  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  27.59 
 
 
588 aa  203  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  28.9 
 
 
605 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  28.82 
 
 
574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  31.33 
 
 
587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  28.08 
 
 
583 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  30.17 
 
 
584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2758  sulphate transporter  29.48 
 
 
574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  31.14 
 
 
559 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  25.33 
 
 
626 aa  197  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  29.27 
 
 
556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  27.74 
 
 
556 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  29.08 
 
 
565 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  30.4 
 
 
581 aa  197  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  29.02 
 
 
592 aa  196  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  29.07 
 
 
571 aa  196  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  30.67 
 
 
569 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  27.11 
 
 
576 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  26.27 
 
 
572 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2014  sulfate permease family protein  29.47 
 
 
592 aa  194  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1066  sulphate transporter  29.61 
 
 
576 aa  193  9e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  26.81 
 
 
585 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  27.3 
 
 
588 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  26.46 
 
 
577 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>