More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1430 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 
398 aa  797    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1540  phosphoglycerate kinase  76.71 
 
 
395 aa  624  1e-178  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0574001  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0928  phosphoglycerate kinase  58.67 
 
 
403 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.356711  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  56.35 
 
 
394 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_002936  DET0744  phosphoglycerate kinase  54.04 
 
 
397 aa  449  1e-125  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  53.57 
 
 
393 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_651  phosphoglycerate kinase  54.04 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  54.27 
 
 
650 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0674  phosphoglycerate kinase  53.54 
 
 
397 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  54.68 
 
 
394 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  54.43 
 
 
394 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  54.06 
 
 
393 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  54.52 
 
 
396 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  55.33 
 
 
392 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  51.4 
 
 
395 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 
394 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  53.67 
 
 
395 aa  418  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  53.3 
 
 
393 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 
400 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  51.52 
 
 
393 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.49 
 
 
646 aa  408  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 
397 aa  411  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  52.01 
 
 
401 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 
395 aa  410  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
394 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  53.05 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
394 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
394 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
394 aa  403  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
402 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
398 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  53.09 
 
 
401 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  52.28 
 
 
394 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  51.65 
 
 
395 aa  404  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  50.26 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  49.62 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  50.5 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  52.15 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  52.07 
 
 
401 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 
400 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  49.48 
 
 
402 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  50.9 
 
 
402 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  52.38 
 
 
398 aa  396  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  51.26 
 
 
400 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  53.09 
 
 
406 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  51.81 
 
 
401 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  48.08 
 
 
443 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  48.73 
 
 
394 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  51.86 
 
 
402 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0229  Phosphoglycerate kinase  48.5 
 
 
399 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0693093  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 
397 aa  388  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0057  phosphoglycerate kinase  47.21 
 
 
393 aa  390  1e-107  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  48.49 
 
 
399 aa  388  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  49.24 
 
 
435 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0923  Phosphoglycerate kinase  48.22 
 
 
396 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.314525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
400 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 
397 aa  381  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  48.35 
 
 
396 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
400 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  49.37 
 
 
397 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 
400 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  45.91 
 
 
403 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 
397 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.5 
 
 
655 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  47.22 
 
 
399 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 
397 aa  376  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 
397 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1753  phosphoglycerate kinase  46.7 
 
 
399 aa  377  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.093261  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  48.12 
 
 
402 aa  375  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 
397 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 
397 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  47.31 
 
 
397 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0677  phosphoglycerate kinase  48.33 
 
 
396 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
396 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0135  Phosphoglycerate kinase  46.06 
 
 
407 aa  367  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  48.48 
 
 
396 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  45.74 
 
 
399 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  49.36 
 
 
396 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  47.12 
 
 
403 aa  365  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  46.11 
 
 
399 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  45.74 
 
 
399 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  47 
 
 
399 aa  363  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  49.1 
 
 
396 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  47.34 
 
 
395 aa  363  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  46.75 
 
 
389 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  48.86 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  45.45 
 
 
396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  47.57 
 
 
389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29157  predicted protein  46.45 
 
 
441 aa  356  3.9999999999999996e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>