86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1414 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1414  NADPH-dependent F420 reductase  100 
 
 
225 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0552714  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1400  NADPH-dependent F420 reductase  88.44 
 
 
226 aa  377  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2768  NADPH-dependent F420 reductase  85.78 
 
 
226 aa  371  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.606867 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1258  NADPH-dependent F420 reductase  42.15 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.826887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0864  NADPH-dependent F420 reductase  42.15 
 
 
223 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0798  NADPH-dependent F420 reductase  41.26 
 
 
223 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0821593  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1120  NADPH-dependent F420 reductase  40.36 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0026  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  39.91 
 
 
223 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0190951  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0970  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  40 
 
 
232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.930985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3114  NADPH-dependent F420 reductase  39.55 
 
 
226 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00100508  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1248  NADPH-dependent F420 reductase  38.64 
 
 
223 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307676  normal  0.0614731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0892  NADPH-dependent F420 reductase  36.36 
 
 
222 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3207  NADPH-dependent F420 reductase  35.91 
 
 
231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.63362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3343  NADPH-dependent F420 reductase  34.98 
 
 
232 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.904937  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3174  NADPH-dependent F420 reductase  36.16 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1646  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.45 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4256  NADPH-dependent F420 reductase  36.77 
 
 
226 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.314841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2584  NADPH-dependent f420 reductase  34.86 
 
 
221 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16433 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3151  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.15 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0243  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.39 
 
 
225 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1799  NADPH-dependent F420 reductase  31.82 
 
 
216 aa  111  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252536  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4044  NADPH-dependent F420 reductase  34.82 
 
 
225 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0062  NADPH-dependent F420 reductase  34.47 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0816  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.67 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.428849  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1119  NADPH-dependent F420 reductase  34.96 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1659  NADPH-dependent F420 reductase  33.64 
 
 
216 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.451421  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3403  NADPH-dependent F420 reductase  34.39 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0864  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  34.86 
 
 
222 aa  106  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3495  NADPH-dependent F420 reductase  33.18 
 
 
222 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3589  NADPH-dependent F420 reductase  34.08 
 
 
232 aa  101  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000495197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1760  NADPH-dependent F420 reductase  34.26 
 
 
227 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.00319562 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1025  NADPH-dependent F420 reductase  34.31 
 
 
200 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4409  NADPH-dependent F420 reductase  35.12 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.614636  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0022  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  36.46 
 
 
225 aa  98.2  8e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1562  NADPH-dependent F420 reductase  32.13 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0765  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.66 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00505079 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1231  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  24.89 
 
 
222 aa  91.3  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0196  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  33.99 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000865826  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1428  NADPH-dependent F420 reductase  27.6 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1974  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  28.69 
 
 
242 aa  86.3  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0718  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  35.48 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479373 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0647  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  31.09 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3944  NADPH-dependent F420 reductase  29.07 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.184955  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0240  NADPH-dependent F420 reductase  32.26 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745076  normal  0.341645 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0303  NADPH-dependent F420 reductase  32.13 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18628  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0180  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.3 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.220411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3613  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.91 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.684224  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3941  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.44 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7106  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  31.22 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693363  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1793  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30.63 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0076  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.44 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.685757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3027  reduced coenzyme F420:NADP oxidoreductase  30 
 
 
215 aa  62  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3530  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.78 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.488676 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0327  NADPH-dependent F420 reductase  25.97 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0741  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.17 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0125  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28.78 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36320  predicted dinucleotide-binding enzyme  26.96 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6638  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.09 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1098  putative reductase  31.58 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0151402 
 
 
-
 
NC_003296  RS05455  putative transmemembrane reductase oxidoreductase protein  30.46 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0971515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0904  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.62 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2654  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  31.74 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5762  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  32.83 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.904394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2808  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.91 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1199  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  26.83 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.52333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3176  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  32.28 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4039  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.35 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0594084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2769  hypothetical protein  84 
 
 
43 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.576996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2952  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  30.09 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5114  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.1 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.581328  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00440  predicted dinucleotide-binding enzyme  29.33 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30391  normal  0.0353921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2534  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.23 
 
 
210 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0161  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  25.24 
 
 
316 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0733501  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0061  prephenate dehydrogenase  29.05 
 
 
443 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.532803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1158  prephenate dehydrogenase  29.05 
 
 
439 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0626  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.04 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2055  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  27.32 
 
 
218 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0760  prephenate dehydrogenase  32.17 
 
 
443 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.504632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2205  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  29.47 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302073  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2078  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.237078  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0613  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  27.23 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.356335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2111  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  28 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1722  dinucleotide-binding protein  25.16 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0135732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3011  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  30.1 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8069  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  26.13 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2131  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  28.24 
 
 
219 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>