71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1369 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  64.87 
 
 		 673 aa  895    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  100 
 
 		 677 aa  1390    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  31.76 
 
 		 671 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  30.7 
 
 		 666 aa  310  4e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  29.71 
 
 		 676 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  28.32 
 
 		 658 aa  251  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  28.82 
 
 		 662 aa  250  8e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  29.28 
 
 		 668 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  29.33 
 
 		 660 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  27.47 
 
 		 661 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  27.31 
 
 		 661 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  27.37 
 
 		 663 aa  224  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  25.76 
 
 		 671 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  24.16 
 
 		 660 aa  161  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  26.59 
 
 		 436 aa  150  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  23.03 
 
 		 672 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  31.38 
 
 		 664 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  25.39 
 
 		 660 aa  114  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  22.77 
 
 		 657 aa  107  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  23.74 
 
 		 663 aa  104  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  34.64 
 
 		 683 aa  98.2  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  22.1 
 
 		 699 aa  95.1  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  22.14 
 
 		 693 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  22.14 
 
 		 693 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  20.65 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  31.55 
 
 		 354 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  21.6 
 
 		 690 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  24.29 
 
 		 260 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  30.48 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  30.72 
 
 		 702 aa  58.5  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  22.89 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24.23 
 
 		 1030 aa  53.9  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  26.56 
 
 		 804 aa  53.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  25.09 
 
 		 890 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  28.66 
 
 		 700 aa  52.4  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  26.41 
 
 		 902 aa  51.6  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  25.23 
 
 		 926 aa  51.2  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  29.08 
 
 		 924 aa  50.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1224  nuclease SbcCD, C subunit, putative  24 
 
 		 723 aa  50.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926455 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  38.98 
 
 		 1047 aa  50.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  31.58 
 
 		 789 aa  50.8  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  29.7 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  31.25 
 
 		 895 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  35.62 
 
 		 1226 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  28.17 
 
 		 891 aa  48.5  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  39.39 
 
 		 955 aa  48.5  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  29.46 
 
 		 1046 aa  48.5  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  31.3 
 
 		 995 aa  48.1  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  29.63 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  29.63 
 
 		 1018 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  23.15 
 
 		 686 aa  47.8  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  31.48 
 
 		 1018 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  22.76 
 
 		 1023 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  28.7 
 
 		 1018 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  28.7 
 
 		 1018 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  28.7 
 
 		 1018 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  36.62 
 
 		 1227 aa  45.8  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  33.85 
 
 		 1018 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  29.47 
 
 		 1020 aa  45.8  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4565  hypothetical protein  20.81 
 
 		 665 aa  45.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  29.09 
 
 		 1081 aa  45.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  33.85 
 
 		 1018 aa  45.4  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  28.7 
 
 		 1018 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  27.81 
 
 		 702 aa  45.1  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  30.84 
 
 		 1018 aa  44.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00117  DNA repair ATPase  25.93 
 
 		 704 aa  44.7  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  31.58 
 
 		 1227 aa  44.3  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  30.59 
 
 		 1042 aa  44.3  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  28.17 
 
 		 1018 aa  44.3  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  25.26 
 
 		 851 aa  43.9  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  27.41 
 
 		 1013 aa  43.9  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>